甘蓝型油菜单位点SSR遗传连锁图谱的构建及重要农艺性状的QTL定位

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本研究利用No.2127-17(春性油菜品系)×中油821(半冬性油菜品种)组合F1小孢子培养得到的含115个株系的DH群体在4个环境(2个春性环境和2个半冬性环境)下的田间实验,考察了开花期、株高、一次有效分枝数、主花序长度、主花序角果密度、分枝部位、角果长、每果粒数和千粒重这九个重要农艺性状,结合一张利用单位点的SSR标记构建的遗传连锁图谱,在春性环境和半冬性环境下分别对各个性状进行QTL定位和上位性检测。主要结果如下:  1.利用本实验室自主开发的6类SSR引物,利用JoinMap3.0构建了一张包含363个SSR标记位点(其中359个为单位点)的甘蓝型油菜遗传连锁图谱,该图谱包括19个连锁群(命名为A1-A10,C1-C9),全长2039.2cM,平均间距为5.62cM。将Al-A10连锁群与白菜的物理图谱进行比对,两者具有很好的共线性。  2.两个亲本在大部分的性状×环境组合都表现出显著的差异,所有性状在DH群体中表现为连续分布。用SAS GLM程序分解基因型、环境以及基因型×环境方差分量对表型的影响,并分别计算春性和半冬性环境下各性状的遗传力。各性状均表现出环境间显著差异,并且基因型与环境显著互作。  3.应用WinQTLCart V2.5复合区间作图法对9个性状进行QTL定位,共定位到127个QTL。经Biomercator V2.1整合以后确定为101个consensus-QTL。QTL数目因性状而异,从7-17个不等,大约92%的consensus-QTL只在春性或半冬性环境中出现,只有8%能在春性和半冬性环境中都出现。  4.将每个连锁群上检测到的所有性状的QTL进行整合,一共得17个pleiotropic-QTL,也可以称为QTL簇,每个pleiotropic-QTL包含来自不同性状的QTL2-4个。A2和C6上各有3个QTL簇,是检测到QTL簇最多的连锁群。  5.利用QTLNetwork V2.1软件分两类环境对9个性状上位性互作进行分析。9个性状共检测到13个上位性QTL互作对。其中11个为非QTLs互作对。
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