受镰刀菌酸诱导的节瓜CqWRKY1基因的克隆及表达分析

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节瓜是我国特产蔬菜之一,也是华南地区主要蔬菜作物。由尖孢镰刀菌引起的枯萎病给节瓜生产带来重大损失。而枯萎病是一种土传病害,利用化学防治或轮作等措施难以从根本上消除病害的影响,选育抗枯萎病品种是解决节瓜枯萎病危害问题的根本途径。对于节瓜这类遗传背景狭窄,变异类型少,抗枯萎病资源缺乏的特色蔬菜,加强其枯萎病抗病机制的研究,发掘抗性相关基因对于推动抗病育种工作具有特别重要的意义。WRKY转录因子是一个超基因家族,在植物抗逆境过程中起重要的开关作用。前期课题组构建了尖孢镰刀菌诱导下抑制差减杂交cDNA文库,获得了高质量EST序列,其中部分EST序列与WRKY转录因子具有较高的相似性。为阐明WRKY在节瓜抗枯萎病中的作用,本研究在上述研究基础上获得了一个WRKY转录因子的cDNA全长序列,并对其表达模式进行了研究;为了精确分析目标基因的表达情况,我们运用实时定量PCR技术筛选了节瓜不同实验条件下合适的内参基因。具体结果如下:1.利用RACE技术对一个推定的WRKY EST序列进行克隆,获得了节瓜第一个WRKY基因全长,命名为CqWRKY1。该基因全长2088bp,开放阅读框1746bp,编码581个氨基酸。CqWRKY1蛋白氨基酸序列中含有两个典型的WRKY保守结构域,锌指型结构为C2H2(C-X4-C-X22-23-H-X1-H),属于第I类WRKY转录因子。2.生物信息学分析显示,CqWRKY1蛋白的三级结构主要含有4个反向平行的β折叠及3个无规则卷曲结构,在β折叠的末端还有一个Zn2+结合口袋;CqWRKY1转录因子定位在细胞核中,并且含有两个核定位信号PTKKKVE、PEAKRWR,具有转录和转录调控等功能;同源比对和系统发育树分析表明,节瓜CqWRKY1蛋白与黄瓜WRKYP2进化关系最近,且两者同源性达92%。3.以4个常用看家基因(GAPDH、Actin、UBQ、CYP)和2个新内参基因(CACS、F-box)作为候选内参基因,运用实时荧光定量PCR技术,分析其在节瓜不同组织(根、茎、叶)及不同处理下的表达稳定性。经RefFinder在线软件综合分析,结果表明,节瓜经镰刀菌酸胁迫后Actin和F-box表达都很稳定;水杨酸诱导后,表达最稳定的内参基因是CACS和UBQ;茉莉酸甲酯诱导下最合适的内参基因也是CACS;而在节瓜不同组织中F-box蛋白基因表达稳定性最高;另外,传统常用看家基因GAPDH和CYP在不同试验条件下总体表达水平都比较差,不适合作为相应条件下合适的内参基因。4.利用实时荧光定量PCR技术分析CqWRKY1在不同处理下及不同组织(根、茎、叶)中的表达模式。结果表明,CqWRKY1在镰刀菌酸毒素胁迫下被强烈诱导表达,在12h达到表达最高峰,为对照的80.26倍。此外,CqWRKY1表达受信号分子SA、MeJA诱导。因此判定CqWRKY1转录因子参与枯萎病防御反应的调控,并且其调控作用可能依赖于SA和JA介导的信号途径。
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