香蕉延长因子1A(EF-1A)基因全长cDNA的克隆及其特征分析

来源 :华南热带农业大学 海南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:smailfish2006
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本研究利用96孔板和一对特异的筛库引物,首次筛选得到了香蕉延长因子1A(elongation facator 1A,EF1A)基因的cDNA序列全长。该序列长为1644bp,命名为CDZ02。 在NCBI上用BLASTn和BLASTx对所获得的片段进行同源性分析,结果表明,它与麝香百合延长因子1A(elongation factor-1A)的mRNA有84%的同源性,与烟草延长因子1A的mRNA有83%的同源性,推测CDZ02可能为编码香蕉延长因子1A(EF1A)的基因。GENSCAN在线分析该片段显示其包含了一个完整的ORF。 通过提取总RNA,反转录合成cDNA第一链,根据上面克隆得到的cDNA全长序列设计表达引物,并且以actin基因为内对照进行PCR扩增,即采用RT-PCR的方法对香蕉延长因子1A(EF1A)基因在香蕉果实采后不同时期和香蕉不同器官中表达的特征进行分析。结果显示,该基因在香蕉果实采后以及在香蕉不同器官中的表达都是有差异的。该基因在香蕉果实采后的表达量开始是呈逐渐上升的趋势,这一变化与香蕉果实采后乙烯释放量的变化、果实软化的进程一致。到香蕉果实采后第20天,该基因的表达量达到最高,随后该基因的表达量就开始逐渐下降,到采后第25天,表达量下降了将近50%。另外,该基因在香蕉的根、茎叶和花中表达的差异也很明显,在根中的表达量最高,花中次之,茎叶最低。
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