本文采用密度泛函理论B3LYP 方法,对丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽和五肽分子进行了计算。定义了丙氨酸多肽中的特殊氢原子,对构象中与特殊氢原子有关的主要非键相互作用进行分析,确定了其相应参数及丙氨酸-α-多肽的库仑模型,探讨了电荷、平均电荷在库仑模型中的作用。用本文方法快速判断多肽构象的相对稳定性,得到了满意的结果。具体包括: 1) 以丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽分子的152 个稳定构象为研究对象,定义了丙氨酸-α-多肽中的特殊氢原子,对构象中与特殊氢原子有关的主要非键相互作用进行分析,确定了其相应参数,使用此参数和多肽分子构象的分子坐标或分子结构图,确定构象的相对能量,与密度泛函理论B3LYP 方法得到的相对能量比较,得到了满意的结果。 2) 选择丙氨酸-α-多肽的库仑模型,确定其相应参数K。利用库仑模型、参数K 和密度泛函理论B3LYP/6-31G*方法优化计算的电荷,确定构象的相对能量,与密度泛函理论B3LYP方法得到的相对能量比较,得到了满意的结果。计算四组、五组、六组及十五组平均电荷,探讨电荷及平均电荷在库仑模型中的作用,结果表明,在库仑模型中,使用五组平均电荷比其他平均电荷能更好地确定构象的相对能量,使用密度泛函理论B3LYP/6-31G*方法优化计算的电荷比平均电荷能更好地确定构象的相对能量。