进化发育遗传学认为，发育调控基因体系的进化和变异是引起生物形态多样性的一个重要因素，因而了解发育调控基因体系的进化和变化将有助于了解生命进化的历程。基于对拟南芥和金鱼草等模式植物同源基因体系的研究，人们提出了关于植物开花的ABC模型，并且随着研究的深入和研究对象的拓展，ABC模型已经发展成为ABCDE系统。在这一重要演变过程中，植物MADS-box基因家族研究起了非常重要的作用。 植物MADS-box基因家族在几乎植物发育的每一个重要过程中都起重要调控作用。这一重要基因家族可以分成多个基因亚族，其中包括A-class SQUA-亚族、B-class的AP3/DEF-和PI/GLO-亚族、C-和D-class的AG-亚族以及E-class的AGL2-/AGL6-亚族等。它们分别在花发育的不同过程具有重要调节功能。目前研究比较详细和系统主要是B-class的两个亚族，从裸子植物到基部真双子叶植物、从单子叶植物到真双子叶植物都已经分离到了B-class基因的同源基因；C/D-class的AG-亚族基因也已经从裸子植物中分离到。但是，对于SQUA-亚族基因的研究目前还主要集中在单子叶植物和真双子叶植物中，被子植物基部类群的SQUA-like基因还未见报道；而被子植物基部类群对于整个被子植物起源和进化研究、对于花和花被的起源研究是非常关键的。 古草本三白草科和马兜铃科植物是被子植物系统研究过程中两个非常重要的类群。三白草（Saururus chinensis Baill.）的花形态非常简单，无花被（achlamydeous），非常类似Sarcandra花的结构；细辛（Asarum caudigerum Hance.）的花则只具有一层融合的花被，没有明显分化成为萼片或花瓣，很类似ANITA中Amborella花的结构。因此，从无花被的三白草到单层融合花被的细辛再到结构典型分化的（马蹄香）拟南芥、金鱼草、水稻等，花被的进化经过了一个从无到有、从简单到复杂的过程。因为拟南芥、水稻等植物发育过程有很多重要调控基因参与，研究无被花和单被花的发育调控过程则具有了非常重要的意义。 本论文以三白草和细辛为研究对象，利用3’-和5’-RACE技术分离到了9个花发育过程相关MADS-box基因，利用RT-PCR和原位杂交等技术对它们的时空表达模式进行了分析，重建了它们与已知基因的系统发生树。 结果，三白草和细辛分别有一个基因ScM-1和AcM-1属于SQUA-亚族，为被子植物基部类群中同类型基因首报。它们具有SQUA-like基因的某些典型结构和转录表达模式，但也出现了明显差异。转录模式分析表明，这两个基因的转录分布很广，预示了功能的多样性；对他们进行系统发育分析的结果表明，它们处于整个SQUA-亚族基因的基部位置，这与三白草科和马兜铃科植物处于被子植物较基部的位置相适应。本论文分析还表明，被子植物SQUA-亚族基因可以主要分成Clade I和II两支；SQUA-亚族基因祖先的出现在被子植物分化成单子叶植物和双子叶植物两个主要类群之前；第一个SQUA-like基因功能很可能是多样化的；从第一个SQUA-like基因出现到真双子叶植物SQUA-like基因，SQUA-like基因很可能经历了一个从复杂到具体、从泛化到特异的一个进化历程。 在本论文中分离到的9个MADS-box基因中，有5个属于B-class，AcM-6、AcM-5、AcM-4和ScM-3属于AP3/DEF-亚族，ScM-2基因属于PI/GLO-亚族。除了AcM-6基因以外，其它基因都具有各自亚族基因所具有的典型保守结构。AcM-5和AcM-4基因的转录产物分布非常广泛，除了在根中没有检测得到它们的转录产物之外，在花被、雄蕊和心皮中都有它们的分布；但除了具有几乎与AcM-4基因完全相同的MADS-box和I-region之外，AcM-6基因没有K-domain，而且只在雄蕊和心皮中检测到该基因的转录发生。三白草ScM-3和ScM-2基因也只在花序中表达。 从细辛中分离到的AcM-3基因属于C-class AG-亚族基因，具有AG-亚族基因所具有的典型结构特征。在所有检测用到的材料中，没有检测到该基因在营养器官中的转录发生；它的转录主要发生在各种发育时期的胚珠、雄蕊中。值得注意的结果是，该基因还在花被中具有明显转录存在，而已报道的C-class基因主要在可育性器官中表达；AcM-3基因有可能处于从D-功能AG-like向C-功能AG-like基因过渡的位置。另外一个细辛基因AcM-2属于TM3-亚族，具有TM3-亚族的明显结构特征。AcM-2主要在营养器官中表达，在花被、雄蕊和心皮中没有明显转录信号；因而该基因很可能主要参与了营养生长调控或者是在细辛花发育的早期起作用。 总之，被子植物基部类群中已经具有了SQUA-like基因，该基因的功能很可能是多样化的；无被花和单被花发育过程中很可能象拟南芥、水稻等植物那样也需要SQUA-like和B-class基因的参与；第一个SQUA-like基因可能出现早于单子叶植物和真双子叶植物的分化；虽然具有A、B、C-class基因的同源基因，ABC模型可能并不完全适用于基部类群被子植物的开花过程。