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低温冷害是水稻生长过程中常见的逆境之一,会严重影响水稻的生产,相比其它时期冷害,孕穗期冷害给水稻生产带来的损失最大,一直以来,研究者们围绕孕穗期耐冷性的定位以及遗传分析开展了很多相关研究。R727是由孕穗期极耐冷的云南地方粳稻品种昆明小白谷与日本粳稻品种十和田的重组自交系中耐冷选系,利用R727和孕穗期冷敏感籼稻品种93-11配制杂交组合,获得F3分离家系和BC1F2回交分离群体,通过构建遗传图谱对孕穗期耐冷性进行QTL定位分析,分别在F3群体检测到9个QTL位点,BC1F2群体检测到6个QTL位点。其中,4个主效QTL位点在两个不同世代的群体中均被检测到,即位于4号染色体SSR标记Y33-RM7187之间的耐冷QTLqCTB4.2,其LOD值8.21(F3)和10.18(BC1F2),表型贡献率为25.77%和29.37%,它与之前克隆的孕穗期耐冷基因Ctb1位于同一区间;位于2号染色体标记Y16-Y17之间的qCTB2.1,LOD值分别为6.15和5.74,解释23.42%和19.13%的表型变异;位于8号染色体标记W66-RM3702之间的qCTB8.1,LOD值为10.88和9.18,解释21.98%和18.67%的表型变异,为一个新的主效QTL;qCTB11.1(qCTB11.2)位于标记 W77 和 Y82(Y81)间,LOD 值为 5.11 和 6.40,解释 18.22%和20.07%的表型变异。其余的7个QTL分别在两个群体中单独检测到,其中在F3群体中检测到的qCTB12.1的LOD值为5.94、贡献率为21.29%,其余的QTL效应很小。因此,R727孕穗期强耐冷性是由多个位点共同作用的结果。粒宽是与水稻产量相关的粒形性状,同时也是影响水稻品质的因素之一,其研究对水稻育种及生产具有重要指导意义。前期研究选用大粒地方品种螃蟹谷和窄粒半矮杆籼稻品系N-643为亲本材料,经杂交、自交、回交后,利用BC2回交群体,于5号染色体检测到一个粒宽主效QTL位点,qGW5.2,位于标记RMw513-RM18068间,其LOD值为17.5,贡献率为57.3%。在前期定位基础上,本研究以GW5或GS5基因邻近标记筛选分离群体中的交换株,并对双亲中GW5和GS5基因测序,验证定位结果,发现qGW5.2位于标记RMw513-L529间,与前期结果吻合,测序比对结果表明qGW5.2对螃蟹谷粒宽的增效作用与GW5和GS5的作用没有关系,因此认为,qGW5.2是一个新的粒宽基因。