弥漫性浅表性光敏性汗孔角化症致病基因定位与候选基因突变检测

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弥漫性浅表性光敏性汗孔角化症(disseminated superficial actinic porokeratosis,DSAP,MIM:DSAP1 175900/DSAP2 607728)是一种罕见的常染色体显性遗传皮肤病。以众多的、环形的皮疹为特征,一般十几岁发病,皮疹多发生于皮肤的阳光暴露区,周边角质嵴稍隆起,中央呈轻度萎缩。利用连锁定位方法,我室曾将DSAP1疾病基因定位在12q23.2-24.1上D12S1727和D12S1605之间9.6cM范围内。随后,我们证明该疾患具有遗传异质性,并将DSAP2定位在15q25.1-26.1上D15S1023和D15S1030之间6.4cM范围内。 为了证实并缩小弥漫性浅表性光敏性汗孔角化症疾病基因的定位区间及克隆该病的致病基因。我们对一个遗传了5代共29人(其中患者14人,正常15人)的弥漫性浅表性光敏性汗孔角化症家系进行基因组扫描和连锁分析,结果显示该家系与染色体12q连锁,精细定位和染色体重组分析提示该家系疾病基因定位在D12S338和D12S1341之间10.6cM范围内。结合以往的研究结果,DSAP1位点远端标记为D12S1605,DSAP1很可能定位在12q23.2-24.1上D12S338和D12S1605之间4.4cM范围内。 分析UCSC、NCBI数据库D12S338和D12S1605之间4.4cM区域及其附近的基因资料,共筛选到24个候选基因(AK002128,HCF-2,NFYB,TXNRD1,BC13935,CHST11,SLC41A2,MGC40397,FLJ38508,KIAA1033,DIP13B,ARK5,CKAP4,MGC40368,POLR3B,RFX4,hSyn,MGC17943,LOC80298,CRY1,PWP1,PRDM4,KIAA0789,CMKLR1)。分析Celera数据库D12S338和D12S1605之间4.4cM区域及其附近的基因资料,共筛选到11个候选基因(hCG1793655,hCG1640816,hCG1820714,hCG1820713,hCG1781967,hCG16109,hCG1781850,hCG1820715,hCG16511,hCG16515,hCG1789758)。因该疾病致病机理未明,且许多候选基因的功能也不明,故对这35个基因全部进行突变检测,在基因的外显子以及外显子与内含子交界位置设计引物行PCR扩增,对产物测序进行突变筛查,在安徽淮南和湖南望城两个家系中共检测了33个基因(hCG1781967,hCG1781850两个基因在多个染色体上有拷贝,难以扩增停做),发现116个遗传变异,其中NCBIdbSNP数据库已收录32个,84个为新发现的变异。两个家系及10-15个遗传无关正常个体分析显示所有这些变异不与疾病表型共分离,提示这些变异
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