风心病合并房颤患者心肌组织microRNA-661表达差异分析及其靶基因预测研究

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目的研究风心病合并房颤患者心肌组织micro RNA-661的表达差异并进行验证,分析其下游可能调控与房颤有关的靶基因,旨在探讨房颤发生机制中mi RNAs的作用,为进一步研究奠定基础,并寻求安全有效治疗房颤的药物提供新靶点。方法(1)经知情同意,采集风心病瓣膜置换术患者右心耳心肌组织约250mg入组研究,分为风心病合并房颤组与风心病无房颤组共4例;(2)以Affymetrix mi RNA芯片对风心病合并房颤与风心病无房颤患者的心肌组织进行mi RNAs表达谱检测,应用RMA数据分析,FC法初步筛选出其差异表达mi RNAs;(3)采用RT-q PCR的方法对筛选出的有意义的mi RNAs(hsa-mi RNA-661和hsa-mi RNA-4800-3p)进行验证研究,应用2-??Ct方法分析两组心肌组织差异表达的mi RNAs;(4)运用生物信息学软件预测mi RNAs靶基因、文献检索及GO和KEGG的分析,在mi RNA水平上探讨风心病合并房颤发生与维持的可能分子机制。结果(1)风心病合并房颤组与风心病无房颤组相比,其心肌组织中22条有差异mi RNAs的相对表达量,其中6条mi RNAs表达上调,16条mi RNAs表达下调;(2)验证研究结果表明与风心病无房颤组比较,风心病有房颤组hsa-mi R-661相对表达显著下调(P<0.01),而hsa-mi R-4800-3p相对表达没有统计学意义变化(P=0.757);(3)预测hsa-mi R-661共同靶基因44个,42个靶基因尚未见与房颤有关的NCBI Pub Med相关报道;(4)经GO和KEGG数据分析,确定hsa-mi R-661靶基因分别参与心肌组织发育、细胞增殖、生长调节功能,作用于肌节、肌原纤维、收缩纤维,与附着和连接、转录因子活性调控、炎症关联等生物学过程,分别集中在Wnt、CYTOSKELETON、ADHERENS、JUNCTION、ENDOCYTOSIS、TGF-β和MAPK等信号通路上,其中以Wnt通路显著富集指数最高。结论(1)风心病合并房颤患者心肌组织mi RNA基因表达谱存在多种差异,房颤形成可能是多种mi RNA通过其介导的下游靶基因共同调控的结果;(2)验证研究显示在风湿性瓣膜病合并房颤组织中hsa-mi R-661显著下调,hsa-mi R-661的表达量与房颤相关;(3)预测获得hsa-mi R-661靶基因44个,其中42个靶基因尚未见与房颤有关的NCBI Pub Med相关报道;(4)通过生物功能和信号通路分析显示,hsa-mi R-661对AF的调控显著体现在细胞外基质合成、代谢及Wnt信号通路上;(5)hsa-mi R-661可能作为房颤标志物和药物治疗新靶点。
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