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四川省甘孜州地处川西高原，是四川盆地西缘山地向青藏高原过渡的地带，自然条件复杂，气候多变。该地区药用植物丰富，共计800余种，是中国名贵中药材的主要产区。常年生长于高海拔、高辐射、温差大等极端环境中的药用植物，为植物内生放线菌的筛选提供了丰富资源。
本研究以甘孜州地区药用植物为研究对象，结合传统分离方法、活性筛选及分子生物学的技术，对药用植物内生放线菌的多样性和抗菌促生功能进行分析。从44种药用植物中分离了215株内生放线菌。根据放线菌的形态特征和BOXAIR-PCR指纹图谱分析，选取84株代表菌株，16S rRNA测序结果表明，这些内生放线菌属于8个属，分别是链霉菌属（Streptomyces）、假诺卡氏菌属（Pseudonocardia）、短杆菌属（Brevibacterium）、韩国生工菌属（Kribbella）、拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)、发仙菌属（Pilimelia）、微杆菌属（Microbacterium）、诺卡氏菌属（Nocardia），以链霉菌为药用植物内放线菌的优势种群。
84株代表菌株的抗菌活性初筛结果显示，58.6％的菌株对供试的病原菌表现出不同程度的抗性。其中对西瓜枯萎菌拮抗效果最好，对大肠杆菌、沙门氏菌、肺炎克雷伯氏菌拮抗效果较差;对7种功能基因进行扩增，PKSⅠ、PKSⅡ、NRPS、Halo、CYP、phzE、dTGD的阳性检出率分别为32.1％、64.3％、33.3％、26.2％、46.4％、36.9％、34.5％，其中PKSⅡ所占比例最高，进一步构建了PKSⅡKSa基因簇序列的系统发育树，结果表明甘孜州地区药用植物的PKSⅡ功能基因一部分与色素产生相关，一部分与产生芳香聚酮类化合物的合成关系密切。
对药用植物内生放线菌促生能力进行检测，38.1％的菌株具有产IAA的能力，31.0％的菌株具有产几丁质酶的能力和产纤维素酶的能力，20.2％的菌株具有产蛋白酶的能力，16.7％的菌株具有产铁载体的能力，而具有溶磷能力的菌株只有15.5％。根据药用植物内生放线菌的促生初筛结果，以药用植物白芨为材料，选取促生效果较好的菌株2、12、20、49、72、122、156、179以及混合处理（菌株72+菌株2）进行盆栽实验，评价各菌株的促生效果。对白芨的各项生理指标的测定结果表明，大部分菌株均有促生效果，其中菌株20和菌株12效果最好，在菌株12和20的作用下，白芨叶长增长了117.55％和86.47％;分根数增加了91.75％和208.25％;最长根长增长了295.21％和355.09％;茎长增长了112.93％和56.46％;株高增长了320.75％和186.17％;叶宽增加了234.04％和140.43％。揭示了药用植物内生放线菌对白芨的促生作用。
本研究通过传统分离、活性筛选和分子生物学技术，了解甘孜州地区药用植物内生放线菌资源，揭示了该地区药用植物中蕴藏着丰富的内生放线菌资源，而大多数的内生放线菌具有抗菌促生能力，为寻找新的活性物质，开发新的抗菌药物，发掘代替传统化肥农药的微生物菌剂提供了丰富的菌种资源，也为该地区药用植物内生放线菌资源的研究和开发提供了科学参考。
本研究以甘孜州地区药用植物为研究对象，结合传统分离方法、活性筛选及分子生物学的技术，对药用植物内生放线菌的多样性和抗菌促生功能进行分析。从44种药用植物中分离了215株内生放线菌。根据放线菌的形态特征和BOXAIR-PCR指纹图谱分析，选取84株代表菌株，16S rRNA测序结果表明，这些内生放线菌属于8个属，分别是链霉菌属（Streptomyces）、假诺卡氏菌属（Pseudonocardia）、短杆菌属（Brevibacterium）、韩国生工菌属（Kribbella）、拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)、发仙菌属（Pilimelia）、微杆菌属（Microbacterium）、诺卡氏菌属（Nocardia），以链霉菌为药用植物内放线菌的优势种群。
84株代表菌株的抗菌活性初筛结果显示，58.6％的菌株对供试的病原菌表现出不同程度的抗性。其中对西瓜枯萎菌拮抗效果最好，对大肠杆菌、沙门氏菌、肺炎克雷伯氏菌拮抗效果较差;对7种功能基因进行扩增，PKSⅠ、PKSⅡ、NRPS、Halo、CYP、phzE、dTGD的阳性检出率分别为32.1％、64.3％、33.3％、26.2％、46.4％、36.9％、34.5％，其中PKSⅡ所占比例最高，进一步构建了PKSⅡKSa基因簇序列的系统发育树，结果表明甘孜州地区药用植物的PKSⅡ功能基因一部分与色素产生相关，一部分与产生芳香聚酮类化合物的合成关系密切。
对药用植物内生放线菌促生能力进行检测，38.1％的菌株具有产IAA的能力，31.0％的菌株具有产几丁质酶的能力和产纤维素酶的能力，20.2％的菌株具有产蛋白酶的能力，16.7％的菌株具有产铁载体的能力，而具有溶磷能力的菌株只有15.5％。根据药用植物内生放线菌的促生初筛结果，以药用植物白芨为材料，选取促生效果较好的菌株2、12、20、49、72、122、156、179以及混合处理（菌株72+菌株2）进行盆栽实验，评价各菌株的促生效果。对白芨的各项生理指标的测定结果表明，大部分菌株均有促生效果，其中菌株20和菌株12效果最好，在菌株12和20的作用下，白芨叶长增长了117.55％和86.47％;分根数增加了91.75％和208.25％;最长根长增长了295.21％和355.09％;茎长增长了112.93％和56.46％;株高增长了320.75％和186.17％;叶宽增加了234.04％和140.43％。揭示了药用植物内生放线菌对白芨的促生作用。
本研究通过传统分离、活性筛选和分子生物学技术，了解甘孜州地区药用植物内生放线菌资源，揭示了该地区药用植物中蕴藏着丰富的内生放线菌资源，而大多数的内生放线菌具有抗菌促生能力，为寻找新的活性物质，开发新的抗菌药物，发掘代替传统化肥农药的微生物菌剂提供了丰富的菌种资源，也为该地区药用植物内生放线菌资源的研究和开发提供了科学参考。