目的：探讨新疆地区慢性乙型肝炎患者HBV基因分型及HBV-DNA水平与HBV耐药变异的关系。方法：收集200例慢性乙型肝炎患者的血清，采用PCR-荧光探针法检测其血清HBV-DNA量，应用实时荧光PCR技术，对其进行HBV基因分型。采用芯片法对其HBV拉米夫定及阿德福韦酯相关耐药突变位点（包括180位点、204位点、181位点、236位点）进行耐药检测。结果：（1）HBV基因型在不同性别及年龄间的分布无统计学差异（χ~2=1.818，P=0.611；χ~2=18.406，P=0.080），而在不同民族间的分布差异有统计学意义（χ~2=89.588，P=0.000）。（2）HBV常见耐药位点的突变差异有统计学意义（P值均小于0.05）。（3）HBV的基因型不同，其耐药突变检出率不同(χ~2=33.348，P=0.000)，其中C/D混合型的突变检出率达到96.7%。（4）HBV常见变异类型的基因型构成差异经统计学分析无意义(χ~2=16.193，P=0.369)。但C型HBV在各变异类型中所占的比例均最高。（5）乙型肝炎病毒的耐药突变率在不同HBV-DNA水平之间的差异有统计学意义（P值均小于0.05）。但在HBV-DNA中水平（105-107IU/ml）及高水平（≥107IU/ml）之间HBV突变检出率无统计学差异。结论：HBV基因型在不同民族间的分布不同；HBV常见耐药位点的突变情况不同；不同基因型的HBV有着不同的耐药突变率。HBV基因型在常见变异类型中的分布相同。乙肝病毒耐药变异与血清HBV-DNA水平有关，HBV-DNA水平高者，其HBV耐药突变率较高。而当HBV-DNA达到中等以上复制水平时，其耐药突变率与HBV-DNA量无关。