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养驴业是我国的特色畜牧业,近些年伴随着社会对阿胶等产品需求的增长,发展迅猛。但面临的一个重要问题是,传统养驴以役用为主,而目前的养驴业以肉、皮、奶用为目标,因此缺乏专门化优良品种。德州驴是我国大型优良驴品种之一,属于重要的畜禽遗传资源,也是驴产业发展的重要品种。生长发育指标是重要的经济性状,驴的产肉量、产奶量等都与驴的生长发育好坏密切相关。因此,开展驴的生长发育性状遗传基础研究具有重要意义,将为驴专门化品种的分子选育提供理论基础。本研究以德州驴为研究对象,选择了胰岛素样生长因子家族成员1和2基因(insulin like growth factor-1and-2,IGF1和IGF2)、长链脂酰辅酶A合成酶家族成员1和3基因(Long-chain fatty acid COA synthetase-1and-3,ACSL1和ACSL3)作为生长发育的候选基因,首先调查了这些基因在德州驴不同时期、不同组织中的表达量,并在候选基因上共筛选鉴定了13个突变位点,然后分析了多态位点的群体遗传参数及其与德州驴生长发育性状的关系。本研究所得结果如下:1. 对德州驴不同时期、不同组织中IGF1、IGF2、ACSL1和ACSL3基因的表达量分析发现。在心、肝、脾、肺、肾和胃组织中,成年驴IGF1基因的表达量显著高于幼年驴;IGF2基因在幼年驴的7个组织中表达量都高于成年驴;而在幼年和成年德州驴肌肉组织中IGF1、IGF2基因的表达量也与先前报道的随年龄增加而下降是一致的。IGF1、IGF2基因在幼年和成年德州驴心、肝、脾、肺、肾、胃和肌肉组织中的表达量结果,与IGF1基因在动物出生后发挥作用,IGF2基因在动物胚胎时发挥作用的机理相符合。所以IGF1、IGF2基因对德州驴的生长发育存在促进作用。ACSL1基因在成年驴的7个组织中表达量都高于幼年驴;ACSL3基因在成年驴心、肝、脾、肺、肾和胃组织中都高于幼年驴,而在肌肉组织中幼年驴的表达量较高。ACSL1、ACSL3基因在德州驴组织中的规律表达与其他动物的研究结果具有相似性。2. 在德州驴IGF1(NW＿014638758.1)基因内含子中检测出IGF1-1(g.A703862G)和IGF1-2(g.A764500G)2个突变位点;在IGF2(NW＿014638551.1)基因内含子中检测出IGF2-1(g.G281766A)和IGF2-2(g.C291322T)2个突变位点;在ACSL1(NW＿014637410.1)基因中检测出:ACSL1-1(g.3414448-3414447),ACSL1-2(g.3408868-3408867),ACSL1-3(g.3407870-3407863)和ACSL1-4(g.3391562-3391556)4个Indels;在ACSL3(N W＿014637842.1)基因中检测出ACSL3-1(g.859009-859005),ACSL3-2(g.853260-853259),ACSL3-3(g.852141-852137),ACSL3-4(g.850942-850941)和ACSL3-5(g.842395-842394)5个Indels。3. 对IGF1、IGF2、ACSL1和ACSL3基因多态位点的连锁不平衡分析发现,IGF1基因2个位点在德州驴中不存在连锁关系;IGF2基因2位点之间在母、公驴中都处于强连锁关系,r~2的值分别为0.871和0.888;在母驴群体中,ACSL1基因的ACSL1-1和ACSL1-3位点之间存在很强的连锁关系(r~2=0.49),而在公驴中,ACSL1-3和ACSL1-1、ACSL1-4位点的r~2值分别为0.59和0.34;ACSL3基因中ACSL3-2与ACSL3-5位点之间在母驴、公驴内r~2值最大分别为0.82和0.84,暗示多态位点间具有强连锁不平衡。而ACSL3-1和ACSL3-2,ACSL3-1和ACSL3-3,ACSL3-2和ACSL3-4,ACSL3-4和ACSL3-5也在母驴、公驴群体内都表现出强连锁关系(r~2>0.33)。同时依据所有突变位点还构建了频率大于0.05的单倍型并且发现单倍型在德州驴母驴和公驴群体中结果是一致的。4. 对13个多态位点的基因型与生长性状进行关联分析发现,IGF1、IGF2、ACSL1和ACSL3基因多态位点与德州驴生长性状间存在显著关联(P<0.05),即基因型GG(IGF1-1和IGF1-2)、GG(IGF2-1)、CC(IGF2-2)、DD(ACSL1-1)、II(ACSL1-2)、II(ACSL1-3)、DD(ACSL3-1)、II(ACSL3-2)、DD(ACSL3-3)、II(ACSL3-3)的个体在德州驴中表现出更高的生长性状。而在单倍型组合分析中发现,在母驴和公驴中IGF1:Hap1Hap1(GG-GG)、ACSL1:Hap6Hap6(DD-II-II-II)、ACSL3:Hap5Hap5(DD-II-DD-II-II)和母驴IGF2:Hap1Hap1(GG-CC)、公驴IGF2:Hap2Hap2(AA-TT)的单倍型组合表现出较高的生长性状。上述分析结果说明,基因型、单倍型组合与德州驴生长性状的关联分析结果基本是一致的,同时也证明了两者的可靠性。