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采用世界粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的9对微卫星引物,检测了甘肃省7个猪品种(系):地方猪种合作猪、培育品系华特A系和B系及四个外引品种杜洛克、长白、大约克夏和皮特兰,共计273个样品的基因型。通过计算等位基因频率、遗传杂合度、多态信息含量、奈氏标准遗传距离,分析品种(系)内和品种(系)间的遗传变异。采用邻近结合法及非加权组对算术平均法,进行聚类分析。以期从分子水平来揭示现阶段甘肃省猪种资源的丰富度和遗传差异,从而为甘肃猪种资源的保护、开发利用、科学选育和合理杂交等提供理论依据。结果表明:1.在9个微卫星座位中,所有位点共检测到131个等位基因,每个位点有8个以上等位基因,说明9个微卫星位点都具有较高的多态性。2.7个甘肃省猪品种(系)的9个位点的平均杂合度都较高,在0.7427～0.8109之间,皮特兰最小,大约克夏最大。平均多态信息含量(PIC)在0.6820～0.7807之间,均表现为高度多态,说明群体内变异性大。对于外引品种而言选育的潜力大,而对于华特A系、B系与合作猪而言,已经导入外源基因,需要近一步纯化基因。皮特兰猪由于在甘肃省数量较少,遗传基础较窄,所以杂合度相对较低。3.7个甘肃省猪品种(系)间的DA遗传距离和DS遗传距离得到了一致的结果:华特B系与大约克夏遗传距离较小,合作猪与其他6个猪品种(系)间的遗传距离较大。4.根据奈氏遗传距离及奈氏标准遗传距离,绘制了甘肃省7品种(系)猪的UPGMA及NJ聚类图,结果显示:两个国外品种大约克和杜洛克聚为一类,引进品种长白和培育品系华特B系聚为一类,地方品种合作猪另成一类。两种方法的聚类一致。在奈氏遗传距离绘制的UPGMA聚类图中,华特A系单独聚为一类,皮特兰和大约克夏、杜洛克、华特B系和长白聚为一类。5.甘肃省猪种资源已引入了一定程度的外源基因,基因的纯化和遗传多样性保护已受到严重威胁。