PAX8-AS1基因多态性与肺癌易感性的关系

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xingyuan77
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目的:在我国,肺癌是一种常见的恶性肿瘤,给我国造成了严重的疾病负担。因此,研究引起肺癌发生的环境因素和遗传因素变得尤为重要。大量的流行病学调查证明烟草暴露是肺癌发生的主要环境危险因素。除了环境危险因素之外,遗传因素包括基因多态性是肺癌发生发展最为关键的影响因素。长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,LncRNAs)与多种类型癌症的致癌过程密不可分。PAX8在非小细胞肺癌中过表达,并推测PAX8很可能干扰P53转录而促进肿瘤的发展。进一步研究还发现PAX8基因的沉默可以降低非小细胞肺癌的活性和迁移。本研究首次探索lncRNA PAX8-AS1的rs4848320和rs1110839多态性与肺癌易感性的关系。方法:1.实验方法:本研究采用以医院为基础的病例-对照研究方法,总共纳入434例肺癌患者和593例正常对照为研究对象,采集所有纳入的研究对象5ml外周静脉血,然后,采用经典酚-氯仿方法提取抗凝血基因组DNA。利用Taqman~?实时荧光定量PCR基因分型技术对两个rs4848320和rs1110839位点进行基因分型。2.统计分析方法:首先,采用t检验,卡方检验和Logistic回归分析比较肺癌病例组与对照组的年龄、性别以及吸烟状况分布的差异。其次,应用Logistic回归分析计算OR值及其95%置信区间去评估两个rs4848320和rs1110839位点基因型与肺癌发生风险之间的关系。最后,评价rs4848320和rs1110839位点多态性与吸烟的交互作用。(1)叉生分析法计算PAX8-AS1 SNP多态性与吸烟的交互作用。(2)利用超额相对危险度(RERI),归因交互效应百分比(AP)以及效应指数(S)评估PAX8-AS1 SNP多态性与吸烟的相加模型交互作用。本文涉及的所有统计分析均采用SPSS20.0软件。结果:本研究未发现PAX8-AS1 rs4848320和rs1110839位点多态性与肺癌易感性有统计学上的关联。然而,在吸烟亚组中,与携带纯合野生型CC个体相比,携带rs4848320 CT或TT基因型的个体发生肺癌的风险显著增加92.9%(OR=1.929,95%CI=1.070-3.479,P=0.029)。与携带C等位基因的个体相比,携带rs4848320 T等位基因的个体罹患肺癌风险增加96.6%(T vs.C:OR=1.966,95%CI=1.185-3.261,P=0.008)。与携带纯合野生型TT的个体相比,携带rs1110839纯合突变基因型GG的个体罹患肺癌的发病风险增加2.224倍(OR=3.224,95%CI=1.089-9.544,P=0.034)。与T等位基因携带者相比,携带rs1110839 G等位基因的个体罹患肺癌风险增加53.0%(G vs.T:OR=1.530,95%CI=1.028-2.278,P=0.036)。在男性亚组中,除了杂合突变模型,在其他基因模型中,rs1110839多态性与肺癌易感性相关(GG vs.TT:OR=3.096,95%CI=1.343-7.134,P=0.008;TG+GG vs.TT:OR=1.804,95%CI=1.061-3.067,P=0.029;GG vs.TG+TT:OR=2.376,95%CI=1.102-5.121,P=0.027;G vs.T:OR=1.621,95%CI=1.149-2.287,P=0.006)。叉生分析结果表明,与携带纯合野生型CC的非吸烟者相比,携带rs4848320 CT/TT基因型的吸烟者发生肺癌风险增加2.218倍(OR=2.218,95%CI=1.272-3.869,P=0.005)。与携带纯合野生型TT的非吸烟者相比,携带rs1110839 TG/GG基因型的吸烟者发生肺癌风险增加75.5%(OR=1.755,95%CI=1.108-2.781,P=0.017)。相加模型交互作用参数估计值及其95%置信区间显示rs4848320和rs1110839位点多态性与吸烟暴露对肺癌发病无显著的相加模型交互作用。结论:PAX8-AS1的rs4848320和rs1110839位点多态性与肺癌发生风险无关。但是,在吸烟和男性亚组中,PAX8-AS1 rs4848320和rs1110839位点多态性与肺癌易感性有关。
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