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本文于2009年10月、2010年1月、2010年4月以及2010年8月对大亚湾海域9个站位进行沉积物样品采集，对大亚湾海域小型底栖生物的栖息环境，小型底栖生物的组成、丰度、生物量、生产量和群落结构及其多样性，自由生活海洋线虫的群落结构、多样性及其分类进行了研究。本文系对大亚湾海域小型底栖生物群落结构及多样性的首次系统研究。
此次调查水深最浅处为(5.40±0.21)米，最深处为(15.70±1.24)米，调查区域的底层水温在16.0℃-30.53℃范围，季节变化呈现夏季＞秋季＞春季＞冬季。盐度无显著季节和站位差异，在28.54-33.66之间变化。调查区域底质以粘土质粉砂为主，以粉砂质砂为次位。沉积物含水率为45.32％-65.85％，在各站位和季节间无显著差异。各调查站位沉积物叶绿素a在季节变化上存在显著差异，呈现秋季＞夏季＞冬季＞春季，在调查站位间差异不显著，在垂直分布上也无显著差异。沉积物的有机质含量在时间与空间分布上同样无显著差异，为0.66％-2.99％。经Pearson相关分析得知，盐度与水深呈极显著正相关;中值粒径与沉积物粘土+粉砂含量为极显著正相关;沉积物含水率与水深呈显著负相关，与沉积物类型呈显著正相关;而沉积物叶绿素含量与底层水温呈显著负相关。
本次调查共鉴定出小型底栖动物19个类群，包括线虫、桡足类、多毛类、寡毛类、动吻动物、双壳类、介形类、星虫类、纽虫动物、水螅纲、腹毛动物、海螨类、涡虫、棘皮动物、端足目、涟虫、曳鳃动物、原足目以及轮虫。小型底栖动物的平均丰度为(993.57±268.74)ind./10cm2，其中线虫为绝对优势类群，占总丰度的95.60％，其次是桡足类和多毛类，分别占1.55％和1.39％。大亚湾小型底栖动物的生物量与生产量分别为(147.91±61.26)μgdwt/10cm2-(1527.56±495.62)μgdwt/10cm2和(1331.30±208.91)μgdwt/10cm2a-1-(13741.24±2014.37)μgdwt/10cm2a-1。与国内外其它海域的研究结果比较，大亚湾小型底栖动物的丰度、生物量的数值与国内其它海域的数值接近，处在同一个数量级。
小型底栖动物丰度在季节变化上呈现春季＞夏季＞冬季＞秋季，在垂直分布上，逾半出现在0-2cm表层，其余在2-5cm与5-10cm层基本均分。小型底栖动物丰度与站位水深呈显著负相关，与沉积物粉砂-粘土含量与中值粒径值呈极显著负相关;小型底栖动物生物量与其丰度与环境因子的相关关系相似，与站位水深、沉积物粉砂-粘土含量及其中值粒径值呈显著负相关。
调查区域共鉴定出65种或分类实体单元的海洋线虫，分属61属，25科，4目。主要优势种是Dorylaimopsisrabalaisi，Parodontoporamarina，Setosabatieriasp.,Hopperiasp.,Terschellingialongicaudata,Sabatieriasp.,Sphaerolaimussp.2,Chromaspirinasp.，Terschellingiacf.gourbaultae，Marylynniasp.。大亚湾海洋线虫的丰富度指数、均匀度指数和多样性指数分别为2.49、0.82和1.66。
大亚湾沉积物中的海洋线虫与桡足比值(N/C)平均值为115.3，在季节变化上呈现春季＞冬季＞秋季＞夏季，在空间和时间变化上差异均显著。总体来说大亚湾N/C值较低，说明除个别站位外，整体沉积环境有机污染较轻。