近几年来,我国卫生事业不断发展并取得了长足的进步。但从长远来看,我国卫生服务利用率并没有得到显著提升,仍存在着卫生服务需求与供给之间不平衡的现象。目前,总投入量不足与浪费并存是制约我国卫生事业发展的主要问题,因此,建立起一套切实可行的医院绩效考核方案,对于合理分配医疗卫生资源、提高医院产出水平具有重要意义。从当前情况来看,医院绩效评价主要指对医疗资源使用情况的一种衡量,通常是考察投入与产出之间的关系,也可看成是使用生产前沿面理论对技术效率的测量。而生产前沿面对技术效率的测量又分为:参数法和非参数法。参数法主要以随机前沿分析法(SFA)为代表,但SFA一般只适合单产出、多投入的生产情形,与医院绩效评价体系不符。非参数法即数据包络分析(DEA)其更加适合处理医院绩效评价领域中面临的多投入、多产出的情况。然而,经典DEA模型是基于横截面数据分析的模型,仅能给出不同决策单元(DMU)之间的静态绩效评价。为了从横向、纵向两个维度进行决策单元(DMU)的动态绩效评价,本文总结归纳了两种面板DEA模型,即DEA-Malmquist生产率指数法、DEA视窗分析方法,同时,在经济学增量分析法相关知识的基础上,本文提出了一种新颖的面板DEA模型,即DEA增量数据分析法,可以对连续两个时期的DMU进行绩效评价,开拓了面板DEA模型研究的新思路,解决了经典DEA模型难以处理面板数据的困境。而通过在算例中将DEA增量数据分析法与其他两种面板DEA模型进行分析和比较,进一步证明了所提模型的优越性和可行性。2009年是深化医疗卫生体制改革的开局之年,本文以江苏省2009-2016年各地区医院为研究对象,旨在对新医改背景下的江苏省各地区医院的运行效率进行动态评价,从横向、纵向两个维度分析和对比各地区医院的运行效率,把握各地区医院的发展变化趋势。在模型研究方面,本文探讨了三种面板DEA模型的优缺点,指出了各自模型的适用情形与局限范围。从实证研究方面,根据各地区医院的数据资料筛选出合适的投入、产出指标,并运用三种面板DEA模型进行效率分析,从2009-2016历年的分析结果来看,各地区医院的效率水平在波动中有所上升,也进一步地证明了新医改政策的可行性和有效性。本文最后提出了相应的建议:第一,重视医院统计工作,强化数据分析职能;第二,医院应实行科学管理,提高整体绩效水平;第三,提升医疗服务水平,不断适应新的要求。