小麦条锈病成株抗性QTL定位和分子标记检测

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 6次 | 上传用户:lalabingku
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小麦条锈病是由条锈菌(Puccinia striiformis f. sp. tritici)引起的真菌病害,是我国小麦的重要病害,在西南西北地区尤为严重。成株抗性的利用有助于培育持久抗性品种,发掘新的成株抗性基因、了解已知成株抗性基因Yr18在我国小麦品种中的分布对培育持久抗锈品种有重要意义。本研究包括三个方面内容:(1)利用单粒传法构建了川麦32/川育12、川育16/川育12和川麦32/川育16三个组合的140个重组自交系(recombinant inbred line, RIL)群体,用3年2点共6个环境的成株期条锈病最大严重度资料,用SSR标记对RIL群体进行抗性基因分子标记作图,用复合区间作图法或完备区间作图法进行QTL定位;(2)用Yr18的功能标记检测我国150份地方品种、47份育成品种和273份CIMMYT引进材料,了解Yr18基因的分布,初步分析Yr18与品种抗性表现的关系;(3)对4份含有Yr18位点抗病等位基因而田间高感条锈病的地方品种进行Yr18位点的序列分析,明确这些材料的Yr18基因序列是否存在变异。本研究的主要结论如下:(1)在川麦32/川育12群体中有2个QTL控制条锈病成株抗性,位于3B染色体上,分别命名为QYr.caas-3BL和QYr.caas-3BS,在不同环境下可共同解释条锈病成株抗性表型变异的6.6-20.1%. QYr.caas-3BL来自抗性亲本川麦32,效应较大,可在5个环境中被稳定检测到;QYr.caas-3BS来自感病亲本川育12,效应较小,仅在1个环境中检测到。QYr.caas-3BL和QYr.caas-3BS与3B上的其它4个抗条锈主效基因和4个QTL位置不同,可能是2个新的条锈病成株抗性QTL。(2)在川育16中有3个QTL控制条锈病成株抗性,分别定位于1B和2A染色体上,命名为QYr. caas-1BL.1、QYr. caas-1BL.2和QYr.caas-2AS,在不同环境下分别解释川育16/川育12群体条锈病成株抗性表型变异的4.3-14.7%、4.6-5.3%和14.7-38.6%;同时在川育16/川育12群体中发现了QYr.caas-1BL.2和QYr.caas-2AS间的上位性QTL,可以解释该群体4.1-6.0%的表型变异。这3个QTL的加性效应和上位性效应是控制川育16条锈病成株抗性的遗传基础,其中QYr.caas-2AS的位置与Yr17相同,是川育16中的主效成株抗性QTL,在川麦32/川育16验证群体中也发现了这个QTL,可解释川麦32/川育16群体的23.2-73.0%的表型变异QYr.caas-1BL.1和QYr.caas-1BL.2是川育16中微效的成株抗性QTL。QYr.caas-1BL.2的位置虽然与Yr29相同,但效应却明显不同;QYr.caas-1BL.1与已定位在1B染色体上的其它抗条锈基因/QTL的位置和效应均不同,可能是1个新的条锈病成株抗性QTL。(3)利用Yr18/Lr34/Pm38位点紧密连锁的分子标记csLV34及6个功能标记cssfrl-cssfr6,检测我国150份小麦地方品种和47份育成品种,于2009年、2010年在成都进行田间条锈病抗性鉴定。在150份地方品种中,119份含有抗性等位基因,但其中37份成株期高感条锈病,用根据已知变异材料Jagger在该位点的序列差异开发的功能标记cssfr7检测这些材料,发现它们均不是Jagger变异类型;去掉这37份高感条锈病的材料,三类品种的条锈病平均严重度的变幅和平均值符合抗性等位基因类型<杂合基因类型<感病等位基因类型。47份育成品种中,5份为抗性等位基因类型,42份是感病等位基因类型;抗性等位基因类型品种的条锈病平均严重度的变幅和平均值均低于感病等位基因类型品种。(4)利用标记csLV34和5个功能标记cssfr1-cssfr5检测273份CIMMYT材料,于2009年在成都进行田间条锈病鉴定,在北京进行田间白粉病鉴定,同时结合这些材料在CIMMYT条锈病和叶锈病的田间鉴定结果。结果表明:在273份CIMMYT材料中,43份携带Yrl8/Lr34/Pm38位点的抗性等位基因,可用于小麦抗病育种;功能标记cssfr1-cssfr5可准确鉴定CIMMYT材料Yrl8/Lr34/Pm38位点的等位变异类型;cssfr3、cssfr4和cssfr5适合于这些CIMMYT小麦材料杂交后代的分子标记辅助选择。(5)根据上述分子标记检测结果,选择4份携带Yrl8/Lr34/Pm38位点抗病等位基因而田间高感条锈病的地方品种,进行Yrl8/Lr34/Pmm38位点编码区和启动子区的序列分析。设计12对引物覆盖Yrl8/Lr34/Pm38位点编码区,7对引物覆盖Yr18/Lr34/Pmm38位点启动子区,扩增该位点的编码区和启动子区,并进行测序分析。结果表明,这4份地方品种在Yrl8/Lr34/Pmm38位点编码区和启动子区序列与抗性等位基因序列没有差异,其感病性可能是由于抑制基因的作用所致。
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