钴多吡啶配合物的DNA键合、光裂解及对接的理论研究

来源 :中山大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhongyi02w
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
钴(Ⅲ)多吡啶配合物具有丰富的光化学、光物理性质、独特的DNA结合能力,在生物领域具有广泛的潜在应用,如可以作为DNA结构探针、DNA分子光开关、肿瘤基因治疗、DNA光裂解试剂等。近年来,大量钴(Ⅲ)多吡啶配合物已被合成和表征,其DNA键合性质、DNA光裂解性质及DNA作用机理也已都被实验所研究,然而,钴多吡啶配合物的DNA键合规律、DNA光裂解性质及DNA作用机理在实验上尚未真正弄清楚,在理论上的研究更为罕见。因此,在实验的基础上,进行上述钴(Ⅲ)多吡啶配合物性质的理论研究,对于设计及合成新型钴(Ⅲ)多吡啶配合物具有十分重要的意义。   本论文运用Gaussian03程序包,采用密度泛函理论(DFT)、含时密度泛函理论(TDDFT)、HF(Hartree-Fock)从头计算及单组态相互作用的(CIS)方法,对若干系列钴(Ⅲ)多吡啶配合物DNA键合倾向、DNA光裂解机理及光谱性质进行理论研究。通过研究系列钴(Ⅲ)多吡啶配合物的几何结构和电子结构,解释配合物的DNA键合性质,获得其调控规律。同时,通过研究钴(Ⅲ)多吡啶配合物基态和激发态的几何结构和电子结构等方面性质,初步探讨了这些配合物的DNA光裂解机理。最后,运用对接软件Dock6.2,把钴(Ⅲ)多吡啶配合物对接到DNA碱基对中,从总体模型上,研究其配合物与DNA碱基对作用的部位、键合性质、电子结构及光谱性质等。   本论文共包括六章:   第一章绪论。综述了量子化学的基本方法和钴多吡啶配合物的研究进展,阐明本论文所选课题的意义。   第二章钴多吡啶配合物[Co(bpy)2(L)]3+(L=pip,odhip,hnoip)(1-3)的DNA键合倾向、光谱性质及主配体的调控作用。主要采用DFT方法,通过研究配合物1-3基态几何结构和电子结构,解释不同取代基对钴(Ⅲ)多吡啶配合物DNA键合倾向的影响,获得主配体调控规律。同时,用TDDFT方法计算配合物的电子吸收光谱,并模拟配合物的电子吸收光谱图。模拟结果表明,以在溶液中优化的配合物结构为基础,在溶液中计算的电子吸收光谱和实验结果吻合较好,这说明溶剂效应对带有较多正电荷的钴(Ⅲ)多吡啶配合物的电子吸收光谱影响较大。   第三章钴多吡啶配合物[Co(L)2(pip)]3+(pip=2-phenylimidazo[4,5-f]-phenanthroline),L=phen(1,10,)phenanthroline,bpy(2,2-bipyridine),en(ethylenediamine)]的DNA键合倾向、光谱性质及辅助配体的调控作用。主要采用DFT方法,通过研究配合物基态几何结构和电子结构,解释不同取代基对钴(Ⅲ)多吡啶配合物的DNA键合倾向的影响,获得辅助配体的调控规律。同时,用TDDFT方法计算配合物的电子吸收光谱,并模拟配合物的电子吸收光谱图。模拟结果进一步表明,以溶液中优化的配合物结构为基础,在溶液中计算的电子吸收光谱和实验结果吻合较好,说明对钴(Ⅲ)多吡啶配合物电子吸收光谱的计算考虑溶液效应是必要的。   第四章钴多吡啶配合物[Co(phen)2L]3+(L=pip,hpip,hnaip)的DNA键合倾向、光谱性质及光裂解机理的理论研究。采用DFT方法,通过研究配合物基态的几何结构和电子结构,分析了配合物主配体内分子氢键和主配体共轭面积对配合物DNA键合倾向的影响;并用TDDFT方法计算、模拟和解释了配合物的电子吸收光谱,得到与实验相符的良好结果。特别是,采用HF和CIS方法研究了配合物基态和最低三重激发态的几何与电子结构,并从光诱导电荷分布变化(或跃迁)的角度初步探讨了钴(Ⅲ)多吡啶配合物的DNA光裂解机理。   第五章钴、钌多吡啶配合物的光谱性质及DNA光裂解机理的比较。选择了两个钴、钌配合物进行研究。采用TDDFT方法,计算了这两个配合物的电子吸收光谱,并对实验上测得的这两个配合物的强吸收带进行了详细解释,分析了溶剂效应对钴、钌配合物电子吸收光谱的影响。同时,用HF和CIS方法计算了它们的基态和激发态的几何与电子结构,分析了配合物基态和最低三重激发态的电荷布居,探讨了它们不同的DNA光裂解机理。最后,总结归纳这两种不同金属的多吡啶配合物在光谱性质及DNA光裂解机理上的重要区别。   第六章钴多吡啶配合物与DNA对接的理论研究。运用对接软件Dock6.2,把钴(Ⅲ)多吡啶配合物对接到DNA碱基对中,从总体模型上,研究钴(Ⅲ)多吡啶配合物与DNA碱基对作用的部位、键合规律、电子结构及光谱性质,深入解释有关的实验现象。   本论文尚有一些不足之处,如研究的一些系列配合物缺乏在同一实验条件下测定的可作定性/定量比较的数据,使论文的深入讨论、调控规律的研究以至论文的学术水平受到一定影响。钴多吡啶配合物DNA光裂解机理及DNA对接的研究是当前国际生物无机化学领域的一个前沿、交叉及具有广阔应用前景的课题,本论文的研究工作及其所获得的规律还是很初步的。今后要将量子化学与计算化学的多种方法有效地结合起来,从配合物与DNA作用的整体模型上探索活性部位、键合规律及光裂解机理,使该课题的研究提高到新的水平。
其他文献
水凝胶作为一种由三维(3D)交联网络并含有大量的水组成的软和湿材料,广泛应用在工业、农业和生物医学等领域。水凝胶可以采用很多方法制备,如辐射、热处理、冷冻解冻(FT)和基
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
现如今,“剩男剩女”婚恋问题成为社会焦点之一,所以“相亲交友类节目”应运而生,给大龄男女搭建更多接触外界的平台。在参加这类节目过程中,男孩女孩能够有更多的接触机会,
石种:马达加斯加玛瑙规格:9cm×7cm×3cm明艳俏丽的马达加斯加玛瑙,如泣如醉的乌鸦皮籽料,奇绝无比。黑底绛黄的画面中,观音发髻高耸、佛光环首、左托净瓶、右拂柳枝、神情自
本论文简要评述了电化学发光分析法的发展过程及其研究现状,在总结大量国内外研究成果和本课题组掌握的知识基础上,对固定钌联吡啶的新材料和新方法进行了系统的研究与探索,进而
染料敏化太阳电能池由于其制备工艺简单,制造成本低廉,成为近年来太阳能光电转换领域的研究热点。本文在大量文献调研的基础上,重点研究了聚合物在染料敏化太阳电能池中的应用,主
随着技术推广的不断深化和人们思想观念的不断开放,也为了适应现代化便捷生活的需要,新媒体在现代社会中的应用随处可见。在新媒体环境下,高校进行思想政治教育一方面形式更
本文以互联网类电视节目为分析对象,详细论述了互联网类电视节目的特色及发展对策。这种研究对于我们更清楚、全面的认识我国互联网类电视节目具有重要意义。 In this paper
稀土合金功能材料在高新技术产业中的应用近年来备受关注,稀土在磁性材料、发光材料、储氢材料、催化材料等领域的应用增长迅速。稀土合金功能材料在高新技术中的应用从70年