我国宪法明确了公民的基本权利和义务,对于犯罪嫌疑人,在侦查机关进行侦查与取证阶段,处于被追诉者地位的他们也需要法律保护,但在刑事诉讼阶段,因侦查机关对犯罪嫌疑人缺乏人权保护意识,容易发生暴力执法事件,侵犯犯罪嫌疑人的合法权利,因而对犯罪嫌疑人权利进行司法保护,对切实落实我国法律人人平等的基本内容具有重要意义。首先,本文针对犯罪嫌疑人权利保护的必要性进行了原因和论述,认为兼顾侦查职能和嫌疑人权利具有重要意义。其次,本文从理论与实践两个层面深入分析了我国侦查机关在犯罪嫌疑人权利保障存在问题。并从检察监督缺陷、侦查程序由侦查机关自行控制垄断、律师诉讼权利受限制、侦查程序由侦查机关自行控制垄断等角度分析了产生的原因。最后,本文结合保障犯罪嫌疑人权利问题,以及与侦查机关在侦查阶段的的一些冲突进行了思考,并从完善非法证据,排除规则、提高公安、司法人员的业务素质、提高刑事技术能力、推进刑事和解、法院的司法认定等角度提出了相关的建议。希望通过本文的研究,能够对侦查阶段犯罪嫌疑人权利保障提供些参考。