随着市场经济的不断发展，政治体制改革的不断深化，整个社会结构和政府的社会管理任务都发生了深刻的变化。在经济全球化的今天，现存的政府纵向结构成为国内经济发展的重大影响因素，也是政治体制改革的重大命题。而中国政府纵向关系的主要特征为“职责同构”，主要表现为中央政府与地方政府在机构设置上和职权行使上具有高度的统一性。在政府体系的运行中，这种上下对口的机构设置原则在市场经济条件下不但使政府与职能部门之间“条块矛盾”深化，也使政府之间权责不清。改革开放以来，虽对政府体制进行多次改革，对地方政府权力的授予也多次收放反复，但都未从根本上解决问题。无论是中央政府加强集权还是向地方政府实施放权，权责关系是政府间的纵向关系的关键。转变中央政府与地方政府的关系必须从现有的政府纵向关系结构出发，而怎样使地方政府在中央政府的调控下挖掘自主创新的潜力，使公共资源得到充分利用，应该是研究政府纵向关系的重要切入点。“职责同构”的政府结构模式，改革开放前对于社会主义建设有着积极的历史意义，是计划经济时国家的必然选择，在这种体制下，政府对社会各项事务负责。但随着时代的变化，中国改革开放的不断深入，中央政府继续按传统的管理方式对社会各项事务做统一的规定和要求，使中央政府的统一性和地方政府的多样性在相互博弈中浪费了大量资源。最重要的是，“职责同构”模式的弊端在权力结构、行政体制及部门结构上逐渐显现出来，成为了理顺政府间关系的瓶颈。本文通过对“职责同构”进行解构，并通过对中国历次改革的经验总结，同时结合国外体制改革的案例，从政府职责、机构设置、第三部门和监督体系四个方面提出对策性改革思路。