湿地作为全球三大生态系统之一,是地球生态系统中独特而重要的组成部分。自工业革命以来,地球表生带的人类活动越来越频繁,过度的湿地资源开发及不合理利用,已经严重威胁湿地生态系统的稳定,导致湿地退化现象十分严重,面积大量减少。近年来,国内诸多重要湿地如三江平原湿地、青藏高原湿地、黄河三角洲湿地、红树林湿地、滨海湿地等对于湿地微生物的相关研究已开展较多,而从微生物角度对图们江流域湿地恢复的研究尚处于初始阶段。本文基于土壤时间序列选取图们江下游研究区中的水田、恢复湿地和自然湿地作为研究对象。分析湿地在自然恢复过程中土壤理化性质,利用第二代高通量测序技术研究湿地土壤细菌的多样性和群落结构的变化,以及其内部与环境因子的关系。并基于统计学的方法和主要微生物与土壤营养的关系探究该过程具有指示作用的物种。结果表明:(1)随着湿地自然恢复,土壤理化性质总体上趋向于自然湿地,但磷素呈现出一定的变化规律,pH未发生显著变化。垂直梯度上,各类营养物质含量随着深度逐渐降低。(2)湿地在自然恢复过程中细菌α多样性不断减小,上层和中层多样性降低,到底层微生物多样性趋于一致。自然恢复湿地细菌群落有向自然湿地发展的趋势。(3)湿地恢复过程中细菌群落类型没有发生变化,但细菌群落结构却在该过程中发生一定的变化。研究区主要优势细菌为Proteobacteria、Acidobacteria和Chloroflexi。(4)土壤理化性质主要影响着细菌群落结构,尤其是土壤含水量、有机质、总氮、碱解氮和有效磷显著影响着细菌群落的变化。(5)本研究区湿地在自然恢复过程中具有指示意义的物种有:水田为Gemmatimonadetes;恢复湿地为 Verrucomicrobiae 和 Acidobacteria(从纲水平到科水平);自然湿地为Syntrophobacterales(目水平及其科水平下的Syntrophaceae)、Bacteroidetes_vadinHA17和Anaerolineae(从纲水平到科水平)。这些细菌类群与湿地自然恢复土壤营养状态(C,N,P)密切相关。