独立学院是中国政府利用创新的思维模式解决中国高等教育供需不平衡的产物，是中国民办教育发展的重要组成部分，经过十五年的发展，独立学院现在已承担了近三分之一的本科生培养任务。随着独立学院的发展，独立学院辅导员队伍也在不断壮大。这个队伍责任重大，承担着党和国家交代的大学生思想政治教育任务，有些人形象地称之为“共产党的近卫军”，所以辅导员队伍的发展正在逐渐受到学界和业界的重视，因此关于辅导员的研究也越来越多，但是之前研究的内容大部分指向公办院校，针对独立学院辅导员激励机制的研究并不多。由于独立学院的办学历史普遍较短，理论界对其办学规律尚处于摸索阶段，因此多数独立学院在开展工作时难以找到可供借鉴的成熟经验，在辅导员的激励机制上依旧采用公办高校（尤其是母体学校）的激励措施。这种激励措施的设置与独立学院的长远可持续发展不相适应，不能体现辅导员的实际工作情况，严重地制约了辅导员的工作积极性，造成辅导员这一群体的职业倦怠感与日俱增，导致流失现象严重。基于上述原因，探讨和研究独立学院辅导员激励创新机制，制定出符合独立学院自身办学规律和发展目标的辅导员激励机制，意义重大且迫在眉睫。本文以JC学院作为研究对象，采用人物访谈法、问卷调查法、文献研究法，对JC学院当前辅导员管理中存在的问题进行分析，通过鱼骨图分析法，找出了目前独立学院辅导员在激励机制上存在的问题主要集中在职级划分、薪酬体系、绩效考核、培训机制、晋升发展机制等几个方面。针对存在的主要问题，本文依据马斯诺的需求理论、赫兹伯格双因素理论、费鲁姆的期望值理论等激励理论，结合JC学院辅导员队伍建设的目标和实际情况，在职级划分、薪酬制度、绩效考核、培训机制、晋升发展这五个方面，分析设计了一套新的辅导员激励措施。通过对新旧激励模式的对比，我们发现新的激励措施打破了传统老套的公办院校激励模式，增加了适应新时代新形式的激励方法，提高了辅导员工作的积极性，有利于辅导员队伍的稳定和发展。辅导员激励机制的设计是动态变化的，不同的独立学院在不同的发展时期采取的激励机制是不一样的，需要在发展的过程当中不断地优化和固化，没有绝对有效的模式。所以学习和掌握激励理论，借鉴有关高校的成功经验，建立符合本校实际情况的辅导员激励机制具有十分重要的现实意义。文中有些问题是独立学院共有的,有些问题是JC学院所特有的，本次研究不仅能对JC学院更好的加强辅导员队伍建设起到推动作用，也能为其它独立学院培养辅导员队伍提供一定的借鉴作用。