慢生型大豆根瘤菌USDA110 c-di-GMP相关代谢基因功能鉴定

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:amao01010
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
慢生型大豆根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum USDA110),是一种革兰氏阴性固氮细菌。研究慢生根瘤菌参与共生固氮机理,寻找高效固氮菌株,对于农业生产具有极其重要的经济意义。环鸟苷二磷酸(Cyclic guanosine diphosphate,c-di-GMP)作为胞内第二信使,参与调节细菌运动方式转变、胞外多糖及生物膜形成等多种群体行为过程。含GGDEF结构域的鸟苷环化酶和含EAL或HD-GYP结构域的磷酸二酯酶分别参与c-di-GMP的合成和降解,共同调控胞内c-di-GMP含量变化。随着基因组测序的飞速发展,细菌中这些潜在蛋白质资源被快速挖掘。但是对于能够进行生物固氮的根瘤菌USDA110而言,c-di-GMP合成和降解机制及c-di-GMP在共生过程中的作用尚未得到鉴定。本研究以慢生型大豆根瘤菌USDA110菌株c-di-GMP相关代谢基因为研究对象,探讨根瘤菌c-di-GMP代谢基因酶活及在与植物共生过程中的作用。研究主要结果如下:1.通过生物信息学方法在B.japonicum USDA110鉴定到42个含有GGDEF、EAL或HD-GYP蛋白编码基因。将USDA110菌株16个c-di-GMP代谢基因构建重组质粒转化铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)PAO1及衍生菌株PAO1Δwsp F,通过转化菌株菌落表型初步鉴定相关蛋白酶活。蛋白含有DGC活性,能够产生皱缩表型,含有PDE活性,能够使衍生菌株皱缩表型恢复到野生型菌落表型。基于菌落表型的鉴定结果显示,在含有GGDEF结构域基因中,检测到6个基因具有潜在DGC活性。4个潜在的PDE活性基因中,只有HD-GYP结构域基因bll2340能够使Δwsp F菌落表型由皱缩转变成光滑状态。2.在菌落表型鉴定酶活的基础上,检测16个基因对PAO1及Δwsp F菌株胞外多糖,运动性,生物膜的影响。发现过表达含有GGDEF结构域基因bll4347,bll5123,bll1362,bll7151,blr2401能够提高PAO1胞外多糖及生物膜产量,抑制群游运动。过表达含有HD-GYP结构域基因bll2340,能够使Δwsp F胞外多糖含量有所减少,群游运动不受影响,颤搐运动恢复到野生型水平。3.在USDA110中过表达c-di-GMP合成和降解基因,并与豆科植物华夏三号进行共生实验,使用气相质谱测定根瘤中的乙炔还原酶活性表明,含有过表达GGDEF结构域基因bll4347,bll5123,blr0624,bll2326菌株固氮酶活较高,含有EAL和HD-GYP过表达菌株固氮酶活比较低。推测c-di-GMP参与根瘤形成并影响根瘤菌固氮酶活性。4.通过测定根瘤菌胞外多糖,运动性及豆科植物根际粘附实验,探索c-di-GMP调控根瘤菌与豆科植物共生机理。发现过表达bll4347,bll5123,bll7151,blr0624基因菌株菌落表面有较多黏性物质产生,菌株运动性增强,在根毛边际的黏附能力也增强。过表达bll2326基因的菌株,菌落表面有较多粘性物质产生,菌株运动性和根际粘附能力变化不大。过表达了blr2401,bll7113,bll3041,bll1500,bll6704,bll2340基因菌株菌落表面较为干瘪。bll1362,bll2326,bll3041,blr0402,blr1644,bll2340基因过表达菌株,根毛粘附能力减弱。5.本研究采用过表达慢生根瘤菌USDA110 c-di-GMP相关代谢基因bll5123,blr0624,bll4347,bll7151,得到了4株潜在高运动性、高胞外多糖及根毛粘附能力根瘤菌菌株。本研究选取慢生根瘤菌USDA110 c-di-GMP相关代谢基因作为研究对象,探索通过GGDEF蛋白信号通路影响胞内c-di-GMP水平,构建高共生固氮效应菌株。从GGDEF蛋白信号通路的角度研究胞外多糖的变化,能够深入揭示c-di-GMP影响胞外多糖产量及参与宿主植物结瘤和固氮共生的水平因素,为将来人工提高根瘤菌和植物的共生效率提供理论支持。
其他文献
伪狂犬病(Pseudorabies,PR),也可以称为奥耶斯基病(Aujeszky disease),是由伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)引起的急性、高度接触的病毒传染病,特别是仔猪在感染后死亡惨重,给养猪业造成巨大的损失。伪狂犬病毒在分子结构、蛋白构型等生物学方面均有较为深入的研究报道,却欠缺在长链非编码RNA(Long noncoding RNA,Lnc RNA)层面
康养产业是21世纪的新型产业。随着社会经济高速发展,人民不断追求健康和长寿;同时,我国已进入老龄化社会,健康养老问题日趋严峻。2016年,中央政府发布了《健康中国2030规划纲要》,提出要遵循健康优先的原则,全面提升中华民族健康素质、实现人民健康与经济社会协调发展的国家战略。本文选题以健康中国发展战略为背景,结合相关理论方法与设计实践展开研究。文献研究阐释了“康养”术语的基本概念,包括“健康养生”
“要构建现代农业产业体系、生产体系、经营体系,完善农业支持保护制度,发展多种形式适度规模经营,培育新型农业经营主体,健全农业社会化服务体系,实现小农户和现代农业发展有机衔接。”十九大报告的这个新提法,为增加小农户收入、建设现代农业指明了前进的方向。当前,小农户仍是我国农业经营主体,小农户的农业生产现代化程度直接决定着我国农业现代化的发展水平。小农户与生俱有弱质性,经营规模小且分散化,需寻求其他产业
酸藤子属(Embelia)在传统分类系统中隶属于紫金牛科,在最新的系统发育系统中隶属于广义报春花科。全属大约有130-140种,广泛分布于亚洲南部,太平洋诸岛及非洲等热带及亚热带地区,少数种类分布于大洋洲。在中国,酸藤子属植物主要分布于东南至西南各省地区,其中在云南地区种类最多。泛喜马拉雅地区也称喜马拉雅及其邻近地区,其范围广泛,包括我国四川、西藏以及云南靠近喜马拉雅山脉和横断山脉的部分区域,同时
随着工业化、城镇化的不断推进,大量的重金属通过矿产的开采、工业“三废”的排放、化肥的滥用等人为活动进入土壤环境中,使得土壤重金属镉(Cd)污染日甚一日。目前常用的土壤修复方式是将土壤Cd稳定剂施放到土壤中,暂时性地降低Cd的生物利用度。然而土壤中Cd并没有移除,含量仍然保持不变,存在再度释到环境产生毒害的风险。近年来,各种以海藻酸盐等天然高分子为基底的吸附材料已经可以有效吸附和移除水体中的Cd,但
莴苣种子是典型的有胚乳种子,而且胚被胚乳完全包裹,胚根要突破胚乳种子才能完成萌发。胚根伸长和胚乳弱化都需要细胞壁的修饰,而细胞壁的修饰与果胶甲酯化程度有关。本实验室前期研究发现:莴苣种子萌发过程中,PME和PG的表达在胚根和胚乳帽上具有组织特异性,这可能与果胶的甲酯化程度不同有关;因此推测胚根和胚乳帽细胞壁果胶甲酯化程度在萌发过程中可能会发生变化。果胶的甲酯化程度与果胶的降解以及果胶中果胶钙的数量
银杏(Ginkgo biloba L.)隶属于裸子植物,现存银杏为单科单属,仅一种,为雌雄异株。生产上通常利用雌株来保证种子白果的产出,而雄株一般作为庭院观赏树种或者行道树,具有重要观赏价值。但无法在种子及幼苗期从形态上分辨其性别,以便用于不同途径,只能通过嫁接等方式来保证生产上的应用。前人在银杏性染色体方面,大多集中于细胞学核型分析。最近,基于基因组重测序和转录组数据,银杏的性别决定区域得到初步
全球气候变化与城市化进程的不断加快,导致城市暴雨内涝灾害频发,给城市居民的生命财产安全造成了极大威胁。城市洪涝模拟是解决城市洪涝的关键技术之一,已广泛地应用在排水系统现状评估、城市内涝积水模拟及城市洪涝灾害风险分析。降雨时间尺度和二维网格尺度是影响城市径流模拟及一系列其他水文问题的主要控制因素,尤其在小型城市集水区,具有径流过程快,响应时间短等特点,城市洪涝模拟精度对降雨时间尺度和空间二维网格尺度
当前土壤重金属污染已成为一个日趋严重的全球性问题。镉(cadmium,Cd)和砷(arsenic,As)是水稻非必需且有毒的元素,经常同时存在于受污染的农田土壤中。水稻是重要的粮食作物,对Cd和As的吸收都很高,即使在轻度污染的土壤中,水稻籽粒的Cd/As含量也往往超过安全阈值。研究水稻Cd/As胁迫下相关基因的功能,对于阐明水稻抵抗重金属毒性机理具有十分重要的意义。本研究针对前期转录组筛选出的2
广义报春花科(Primulaceae s.l.)是杜鹃花目中的一个大科,约含58属2590种;广泛分布于热带和温带地区,有较高适应性和多样性。本科植物物种丰富,含有许多观赏、药用植物和快速辐射演化类群,还包括典型的异型花柱模式类群报春花属(Primula L.)。自APGⅢ系统中对本科进行修订以来,在科一级的问题基本理清,但科内各亚科间的界定及一些属的系统位置还未得到清晰的解决。叶绿体基因组结构稳