知识产权的授权确权包括有关机构根据法律规定确认权利的存在及其效力，由对权利的审查与授予，和授予之后对权利的再次确认这两部分构成。基于多方原因，在知识产权领域内的实际操作中，出现了大量商标权效力争议，于是商标授权确权问题成为了知识产权领域内具有重要意义的典型问题。商标权的确定对实现商标权的全面保护至关重要，商标授权确权程序的设置是否合理，对实现商标权人的经济效益、维持市场秩序的稳定有着直接影响。作为商标授权确权中与行政程序比肩的司法审查制度，在我国加入WTO后，正经历着逐渐完备的过程。但由于一些主观或客观原因，造成我国司法审查制度在商标授权确权程序中的应用尚还存在种种不足，尤其与一些国外已经成熟的商标授权确权司法审查程序相比，我国在该制度上改进的余地还很大。当前正值商标法第三次修改之际，探讨深化商标授权确权司法审查制度既有理论意义、又更富实践意义。本文从明确商标授权确权的概念开始，对我国现行商标授权确权的相关法律规定进行了评析，并以美国、日本和德国为典型，分析了商标授权确权司法审查制度的原则以及程序，比较并概括了我国同国外商标授权确权司法审查制度的异同以及我国在该制度上的特点，进而总结出我国商标授权确权司法审查制度中存在的问题。最后，针对机构设置、程序规则、行政审查与司法审查之间的衔接等方面提出建议，从观念与制度两个层面，完成对我国商标授权确权司法审查制度的重构，以期可为商标法的第三次修改提供些许帮助。