株高是大豆重要的形态性状,对大豆生长发育和产量形成有重要影响。同时株高是典型的数量性状,受到多种基因控制且具有连续变异,受环境影响大的特点。研究大豆株高性状,剖析其遗传基础,对分子标记辅助选择育种具有重要意义。课题组前期以株高具有显著差异的两个材料东农L13和合农60为亲本,构建了包含156个家系的RIL6013群体。本研究基于此RIL群体使用SSR标记图谱应用区间作图法(IM)和完备区间作图法(ICIM),对大豆株高表型数据进行6年4点共9个环境的株高QTL(quantitative trait locus)定位。以Williams 82物理图谱为参考背景,根据QTL的物理位置整合前人和本研究定位到的株高性状QTL进行Meta分析。同时结合660K大豆基因芯片技术获得的SNP标记,使用5种多位点全基因组关联分析模型mr MLM,FASTmr MLM,FASTmr EMMA,p LARm EB和ISIS EM-BLASSO,以LOD值>3为阈值进行GWAS分析。之后结合Meta-QTL和GWAS定位得到的QTN(quantitative trait nucleotides),在共同定位的QTN基因组候选区段进行基因注释,预测控制大豆株高的候选基因,并分析它们的功能。得到以下结果:(1)株高的广义遗传力介于74.30%至89.78%之间,表明株高主要受到基因型之间的影响。同时株高在各环境下表现出较强的超亲遗传,适合用于QTL定位。(2)连锁分析共检测到48个QTL其中3个QTL表型贡献率>10%。多方法及多环境定位到9个显著的QTL。与前人研究结果进行对比,发现27个QTL与前人定位的QTL在基因组区域内存在重叠或者交叉区域,新发现21个株高QTL。(3)对本研究定位得到的72个株高QTL结合前人定位的159个株高QTL整合到物理图谱并进行Meta分析,得到49个Meta-QTL,分布在18条连锁群,置信区间大小为0Mb-24.52Mb,平均遗传贡献率为1.71%-32.02%,每个Meta-QTL的原始QTL在2-16之间。(4)基因芯片进行SNP分型经过质量筛选,MAF>5%,最大缺失率<10%,得到54836个非冗余单核苷酸多态性的基因型数据。群体分为2个亚群分别包含64和75个家系。连锁不平衡衰减曲线得到衰减距离为200Kb。使用5种统计模型定位到了10个QTN,多方法下定位到3个QTN。其中4个QTN与之前定位的Meta-QTL存在重叠区域。(5)在这4个QTN左右各100Kb附近搜索所有的基因,共搜索到了57个基因,其中预测了5个大豆株高生长相关的候选基因。通过ensemble plant网站寻找57个基因在拟南芥中的同源基因,找到了18个同源基因,其中4个可能与株高生长相关,有助于我们对大豆株高的多基因调控网络,还有遗传机制的认识,对大豆高产育种有更好地帮助。本研究极大地丰富了大豆株高性状QTL,并挖掘到了与株高生长发育相关的候选基因,为分子辅助选择大豆育种起到了支撑性的作用。