近年来,随着国际贸易和国际技术交流的深入与发展,伪造商标、假冒商品、技术贸易中的侵权等问题也逐渐成为国际贸易中的突出问题。海关作为国家进出境货物、物品的监督管理机关,在防止和制止侵权货物进出境、保护知识产权方面的作用也日益重要。但是,长期并仍然困扰着知识产权海关保护基层执法工作的三大问题:“定牌加工是否认定侵权?平行进口是否应予禁止?专利权海关要不要保护?”依然没有找到明确的出路。虽然,随着我国知识产权保护法律体系的逐步建立、完善,上述问题通过立法对保护程序的重新设计,客观上为海关执法打开了方便之门,降低了海关实施主动保护的风险,减轻了海关的责任,但对于权利人、对于消费者是有欠公允的,甚至可能危害到海关的执法形象。本文试图在现有法律体系框架下,借鉴国外海关执法的有益经验,通过实务分析的方式,讨论知识产权海关保护行政执法如何突围困境,大胆变革,达到既降低执法风险又规范执法行为,理性化的实现知识产权海关保护的目标,以期对知识产权海关执法保护工作有所裨益。