土壤微生物多样性是土壤质量的主要指标之一，而各种人为干扰措施也是影响土壤微生物多样性的重要因子。本文选取长期不同施肥、高强度利用下设施大棚和大气CO2浓度增高3种人为干扰措施来研究其对土壤微生物多样性的影响。　　 长期不同施肥措施条件下研究结果表明：在长期不同施肥处理后，脱氢酶活性、脲酶活性、磷酸酶活性、转化酶活性、土壤微生物生物量碳、氮和微生物数量(细菌、真菌、放线菌)以及玉米菌根侵染率等都有在施加有机肥处理的土壤中(OM与OM+NPK)最高，NPK和NP次之，对照(CK)处理最低的趋势，且与土壤有机碳和全氮含量显著相关；对照与其他施肥处理在碳源总利用能力和微生物群落功能丰富度、均一度和一致性方面存在差异，对照土壤中微生物群落功能不仅种类少，而且分布也不均匀；并且，不同施肥处理土壤微生物群落在CV1-CV2载荷图上位置不同，提示经过长期不同施肥处理后土壤微生物群落的功能多样性已(主要是某些碳源的利用能力)发生了变化。　　 高强度集约化利用条件下研究结果表明：不同土壤类型和不同利用年限下设施大棚土壤中真菌数量显著增加，加大作物发生真菌病害的风险；土壤脲酶活性、磷酸酶活性和转化酶活性在各类设施大棚土壤中没有统一的趋势。Biolog方法测定的土壤微生物功能多样性指数分析和主成份因子分析的结果表明设施大棚利用能改变土壤微生物的群落结构和功能；县级空间尺度上微生物功能多样性指数经计算Kendall和谐系数也证明大棚土壤中土壤微生物的功能多样性降低。　　 PCR-DGGE图谱聚类分析表明，随着设施大棚利用年限的延长，土壤中细菌16SrDNA的DGGE谱型逐渐异化，5-6年大棚土壤2个重复之间DGGE谱型相似度高达85％，而与对照土壤中微生物16SrDNA的DGGE谱型相似度只有47％左右；短期单季不施氮肥在不降低产量的同时不会改变土壤中微生物的数量和主要群落功能，为保护农田土壤微生物多样性提供了思路；大气CO2浓度增高(FACE)对土壤微生物多样性和生化活性影响如下：大气CO2浓度升高在稻季和麦季，对表层(0-5 cm)和亚表层(5-10 cm)土壤中脲酶活性、磷酸酶活性、转化酶活性、微生物生物量碳、微生物生物量氮都未产生可检出的直接影响。稻季和麦季微生物功能多样性结果表明大气CO2浓度升高可能可以提高土壤表层微生物群落的总碳源利用能力；主成份因子分析可以发现麦季FACE表层土壤和对照表层土壤的碳源利用能力的差异主要与顺.乌头酸(丙烯三羧酸)、β-羟基丁酸、γ-羟基丁酸、p-羟基苯乙酸、衣康酸、丙二酸、肌苷等碳源正相关。