【摘 要】
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目的:本研究通过分析中枢神经系统（CNS）感染患儿脑脊液宏基因组二代测序（mNGS）和常规实验室方法检出的病原体情况,探讨mNGS对儿童神经系统感染病原体检测的诊断价值,为临床诊治提供一定参考。方法:收集2019年3月至2021年12月兰州大学第二医院NICU及PICU诊治的42例临床怀疑CNS感染患儿的相关资料:一般情况、常规实验室检查、影像学检查、mNGS检测报告、临床用药及疾病转归情况。以临
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目的:本研究通过分析中枢神经系统（CNS）感染患儿脑脊液宏基因组二代测序（mNGS）和常规实验室方法检出的病原体情况,探讨mNGS对儿童神经系统感染病原体检测的诊断价值,为临床诊治提供一定参考。方法:收集2019年3月至2021年12月兰州大学第二医院NICU及PICU诊治的42例临床怀疑CNS感染患儿的相关资料:一般情况、常规实验室检查、影像学检查、mNGS检测报告、临床用药及疾病转归情况。以临床最终诊断为标准,排除一般资料缺失、最终诊断为非CNS感染患儿,最终纳入病例37例,其中1例患儿为细菌合并病毒感染,故感染总样本为38例。采用IBM SPSS26.0软件进行统计学分析,通过配对四格表卡方检验（Mc Nemar检验）或Fisher’s确切概率法比较mNGS与常规实验室方法对儿童CNS感染病原体诊断的差异性。P＜0.05为差异有统计学意义。结果:（1）38例感染总样本中,mNGS方法检出病原微生物的阳性率为65.79%,而常规实验室方法检出阳性率为21.05%,mNGS病原体检出阳性率较常规实验室方法检出率高,差异有统计学意义（P＜0.05）。（2）在病毒性神经系统感染患儿中,mNGS方法检出病毒的阳性率（90.00%）较常规实验室方法检出阳性率高（50.00%）,差异无统计学意义（P=0.14＞0.05）;在细菌性神经系统感染患儿中,mNGS方法检出细菌的阳性率（55.56%）较常规实验室方法检出阳性率高（11.11%）,差异有统计学意义（P＜0.05）;在1例真菌性神经系统感染患儿中,mNGS检测出白色念珠菌,特异性序列数（SSRN）为989,常规实验室检测均阴性,临床更换抗真菌药物治疗后复查脑脊液指标均较前好转,因病例数仅1例,尚不能进行统计学分析。（3）根据发病日期距离采集脑脊液并送检mNGS检测的时间进行分类,发现间隔时间越短,mNGS检出特异性序列数越高。（4）在已经验性使用抗生素的情况下,mNGS检测阳性率较常规实验室方法病原体检出阳性率高,差异有统计学意义（P＜0.05）。结论:（1）中枢神经系统感染患儿中使用mNGS方法检出病原体阳性率较常规实验室方法检出率高,且受抗生素影响更小,可用于儿童中枢神经系统感染病原体的早期诊断。（2）mNGS方法对细菌性中枢神经系统感染病原体的诊断能力较好,但对不同病原体的诊断能力有一定差异。（3）病程早期采集脑脊液标本并送检有助于提高mNGS检出病原体特异性序列数。
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