中日经济的互补性,使两国经济合作存在巨大潜力。但由于“政治成本”等非经济成本的存在使两国经济合作举步为艰。为进一步挖掘经济、政治、历史等各要素的内在联系,在原有区域理论基础上本人引入了制度变迁理论,使政治、历史、文化等因素同样内生化于国家间经济关系研究之中,从而回答这些因素为什么、又是如何影响经济关系的,以期为中日两国经济合作提出政策建议。制度变迁理论的特性和区域经济理论发展的需要,以及中日经济关系的复杂三者决定了制度变迁理论对国家间经济关系研究的可行性。在三者的结合中可以看出中日虽然具备合作的经济条件,但在大量历史偶然(并非与必然相对,仅只非常态)事件如日本侵华战争的影响下使两国经济关系偏离了均衡状态,并在两国经济关系的发展进程中形成了“历史锁定”、“政治锁定”和“文化锁定”。其对策也必须从正式制度和非正式制度两方面入手,从而推进中日经济关系的制度性合作。