现有的研究揭示家养山羊有A、B、C和D四个线粒体DNA世系，其中世系A的频率最高，世系B中等，世系C和D的频率较低。家养山羊线粒体DNA世系A作为最大的一个支系，拥有最高的分布频率，但其内部单倍型间的进化关系模糊不清。对中国家养山羊世系A的系统发育研究能进一步完善对全球家养山羊系统发育及遗传多样性的了解。前人的研究结果都是基于线粒体DNAD-loop区的序列得出的，由于D-loop区的信息量有限，且进化速率很快，有些位点存在回复突变和平行突变，仅居于D-loop区序列难以确定单倍型间和亚类群间的进化关系，相应的亚类群之间的分歧时间也不能确定。研究较D-loop区为保守的编码基因序列，进一步增加信息量是解决上述问题的关键。 为了进一步了解家养山羊线粒体DNA世系A的内部各个分支之间的关系，本研究对家养山羊线粒体DNA的细胞色素b基因(Cytb)全序列(1140bp)进行测序，共测定了来自中国家养山羊世系A的48个个体，检测到23个突变位点，分辨出17个单倍型，再结合实验室已发表线粒体DNAD-loop区的数据，做进一步研究、分析，探讨中国家养山羊线粒体DNA世系A的系统发育关系。得到四个亚类群，并确定世系A最近共同祖先的时间大约在70，020-98，020年前，这个时间远远高于山羊可能的驯化时间10，000年左右，推测家养山羊世系A的驯化至少涉及到四个已存在遗传分化的建群者。此外，在世系A中检测到群体扩张事件。这个结果仍需增加样本来进一步检验。由于我们所选用的细胞色素b基因的信息量仍然有限，要彻底解决中国家养山羊世系A的系统发育关系，还需要进一步测定更多的线粒体编码基因。