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本研究对来自我国10个麦区468份中国小麦地方种质和育成品种,在多环境下对淀粉含量与组成进行分析,利用Wheat660 SNP以及Wheat55 SNP芯片数据,对淀粉含量进行全基因组关联分析。取得如下主要研究结果:272份中国小麦地方种质总淀粉含量在5个检测环境下平均值为56.45%,变幅为37.86%~70.02%,表观直链淀粉含量平均值为12.50%,变幅7.19%~18.49%。196份2017年崇州四川小麦平均总淀粉含量为57.35%,变幅为53.20%~62.88%,表观直链淀粉平均含量为12.99%,变幅为9.16%~16.41%。利用Wheat660 SNP芯片,对272份中国小麦地方种质淀粉含量进行全基因组关联分析,共检测到29个与总淀粉含量至少在两个环境下稳定显著相关的SNP标记,解释7.7%~11.4%的表型变异。这些SNP标记分布在9个新的QTL区段,分别位于5A、6A、7A、1B、3B、6B和5D染色体上。共鉴定到10个至少在两个环境下稳定与表观直链淀粉含量显著关联的SNP标记,这些关联位点涉及到3个新的QTL区段,分别位于2D、3B和1A染色体上,解释8.3%~12.2%的表型变异。利用Wheat55 SNP芯片,对196份四川小麦淀粉含量进行全基因组关联分析,共检测到33个与总淀粉含量显著相关的SNP标记,解释6.0%~10.2%的表型变异。这些SNP标记分布在14个新的QTL区段,分别位于1A、5A、7A、4B、5B、7B和5D染色体上。共鉴定到16个与表观直链淀粉含量显著关联的SNP标记,这些关联位点涉及到9个新的QTL区段,分别位于1A、3A、1B、4B、7B、1D、3D和5D染色体上,解释5.9%~8.7%的表型变异,但是使用Wheat660芯片和Wheat55芯片进行全基因组关联分析所鉴定到的QTL并没有一致的区段,这可能和材料的遗传背景以及不同芯片的标记的密度有关。通过单倍型分析在9个总淀粉QTL中共发现10个优异单倍型,13个非优异单倍型。