基于荧光显微图像的亚细胞定位算法

来源 :上海师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangshilei19850715
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蛋白质亚细胞定位是分子细胞生物学和蛋白质组学的一个重要研究课题。蛋白质在核糖体内合成之后必须被转运到特定的亚细胞器官,才能发挥其生物学功能,使整个生命机体正常运转。蛋白质的亚细胞定位与其功能密切相关。因此,研究蛋白质的亚细胞定位,有助于了解蛋白质的性能和功能。自动的荧光显微镜技术是目前在光镜水平对特异蛋白质等生物大分子定性定位研究的最有利手段之一,允许蛋白质定位以高通量荧光成像。因此,我们需要一个自动高效的方法能够对亚细胞图像进行量化、区分和分类,关键点在于图像特征的提取以及分类算法的设计。本文主要围绕这一主题,针对蛋白质亚细胞图像的特征提取方法和分类预测算法两方而进行了研究,并在不同的数据集上分别进行了测试和分析。本文的主要创新工作概况如下:本文提出了一种新的蛋白质亚细胞图像提取算法,该算法基于图像局部不变特征,且具有旋转和平移不变性。主要思想是:首先是选取一个阈值对图像进行预处理,小于该闽值的像素点像素值统一置为零,大于或等于阈值的像素点的像素值保持不变,这样我们把图像分割为背景部分和目标部分,在尽量不损失图像信息的情况下,减少特征提取工作量,提高算法效率:其次,对目标区域中的每个像素点,计算其与周围8个像素点的差值,若领域灰度值较小的标记该领域点为0,其余的则标记为1,这样会得到一个邻域二值模型,对该模型进行求和运算(即统计1的个数),其值范围为0-8,这样每幅图像的像素点可归为0-8共9组:最后,对每幅图像,统计其每组像素点的个数,然后再根据邻域差值模型,分别计算出每组像素点的正负差值之和以及差值绝对值的方差,这样每组可计算得到4个统计量,每幅图像我们可以得到9×4=36组特征量。在本文中,我们采用了支持向量机算法作为预测分类工具,在LOCATE Endogenous、LOCATE Transfected和2D HeLa三个不同的蛋白质亚细胞图像集上进行了测试,分类正确率分别为96.7%、92.3%和902%。由结果可知,本文的方法取得了较好的预测效果,与其他方法相比,也具有明显的优势。
其他文献
在对标准长期国际资本流动模型进行改进的基础上,利用动态学原理分析了有外资流入的国内经济实现新稳定状态的过程,发现国内经济会沿着两条收敛速率不同的鞍点路径中的某一条
结合宁波市区地面沉降监测成果,在综合分析的基础上,运用层次分析法(AHP)对水文地质、工程地质、人类城市活动等三个子系统分别进行分析评价,得到各影响因素所占权重;在对历
金水河、熊儿河、东风渠是贯穿郑州市市区的3 大水系,3 大水系建设在改善城市人居环境、经济建设以及城市发展中起到了重要作用。阐述了3 大水系的概况、建设现状、成果及前
新生代农民工市民化进程的顺利推进不仅同广大新生代农民工的个人利益紧密相连,更是我国全面建成小康社会的重要条件。本文从我国城镇化水平、户籍制度、社会保障制度、住房
对比传统无缝针织内衣生产工艺的特点,详细介绍无缝内衣色织工艺的特点,针对3种色织工艺的流程及络筒、预定形、前处理、染色等关键工序的工艺要点进行了充分的分析和研究,给出
足尺路面加速加载试验是国际上先进的一种试验研究手段。面对中国公路建设、养护和管理并重的发展形势,为了适应大交通量和重载交通时代的来临,采用足尺路面加速加载试验方法
保险中介道德问题产生的重要原因是保险中介与其他各方在信息不对称下的博弈中占据信息优势。文章在博弈论的基础上,通过对保险中介理性经济人的假定,分析保险中介失信行为的主
建筑装饰企业的发展,在近几年来出现了一些新问题、新情况、新现象,如何正确看待我省建筑装饰企业在发展中存在的问题和矛盾,我认为我们必须从根本上来查找原因,寻求解决问题
习近平总书记在“六一”前夕给我市12名小学生回信,强调大陈岛垦荒精神,实际上也是号召全国的少年儿童积极培树和践行社会主义核心价值观,“扣好人生第一粒纽扣”,为实现梦想、报
报纸
在长白山区3种类型的酸性土壤上栽培越桔,研究结果表明,‘北空’、‘美登’、‘斯卫克’在暗棕色森林土上生长结果较好,树体营养关系合理;在草甸沼泽土上3个品种生长结果均较