本文主要考察的是《黄帝内经》中的五行学说，通过考察五行学说与《内经》的关系，分析作为哲学思想的五行学说与古代中国医学的关系。本论题主要来源于对现实问题的考察：即中西医论争问题。同时又涉及到中医学的发展问题，特别是中医基础理论问题。因此，本文的目的是以考察历史的源头作为对回答现实问题的参照。使用的方法主要是以对原始材料即《内经》中五行材料的解读、分析，从中发现五行学说是怎样进入古代中国医学的。 本文是通过以下几个部分对上述问题做出解答：在绪论中对本文所论述问题的来源以及所涉及到的相关问题背景做了简要的交待及分析。 前三章主要就本文的核心问题来论述。第一章是分析《内经》中的五行思想。首先是对《内经》中涉及到五行的所有文字材料加以归类、整理、分析，得出五行学说在《内经》中的使用范围比较广，但比较单一。主要是把当时人们所能认识到的事物及观念以“五”归类，并与五行说相配，对五行之间的关系的运用还主要以五行相胜说为基础。第二章分析《内经》中的非五行思想，主要包括天人相应观念，气，阴阳，及其它属于医学的理论。第三章是在前两章的基础上对五行学说与《内经》关系的分析，得出在《内经》成书时期，五行学说在《内经》中的使用是当时人们对散乱的医学实践作整体认识的需要，进而得出五行学说进入中医学也是基于这个原因。它与气、阴阳等其它哲学思想一样对当时的中医学发展起到了总结的作用。这也是《内经》中的医学思想奠定后世中医学基础理论的原因所在。 第四章是以《内经》中的七大论所展示的运气学说为例，与《伤寒杂病论》比较来展示《内经》之后五行学说的演变脉络，为回答现实问题做准备。从历史的发展观点来看待五行学说在中医学中的作用。进入到第五章的总结及回答现实问题的阶段。最后得出结论：五行学说作为一种哲学理论在一定的运用范围内是有效的，超过了这个范围，便会成为中医学发展的阻碍。