稻瘟菌附着胞发育过程的分泌蛋白质组研究

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yx2207
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
由稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病是水稻的重要病害之一,给水稻生产造成了严重威胁。附着胞是稻瘟菌侵染水稻的关键结构,其形成是稻瘟菌侵染水稻的必要条件之一。分泌蛋白作为一类重要的致病因子,在植物病原真菌的致病过程中起着重要作用。但目前关于稻瘟菌分泌蛋白,尤其是附着胞发育过程中分泌蛋白的组成等均缺乏整体的了解。因此,开展稻瘟菌附着胞分泌蛋白质组的研究将丰富稻瘟菌的致病分子机理。本研究采用体外模拟稻瘟菌与水稻互作的研究策略,应用高通量的Shotgun技术,对稻瘟菌附着胞的分泌蛋白进行了高通量鉴定。应用Label-free技术和生物信息学技术,开展稻瘟菌附着胞发育不同阶段的分泌蛋白质组研究,并对其分泌蛋白的差异表达进行了分析。取得的结果如下:1、以PVDF膜为介质,对稻瘟菌分生孢子的萌发情况进行了研究;结果表明分生孢子在PVDF膜上可以正常萌发产生芽管和形成附着胞。采用超滤法,制备了高质量的稻瘟菌附着胞分泌蛋白;表明以PVDF膜作为介质可以模拟开展稻瘟菌早期侵染阶段的分泌蛋白质组研究。2、以附着胞形态建成过程中附着胞发育期(8 h)和附着胞成熟期(24 h)为时间点,采用Shotgun质谱技术,对稻瘟菌附着胞分泌蛋白进行了高通量鉴定与分析。结果表明,有2766个稻瘟菌分泌蛋白得到了鉴定,其中278个为经典分泌蛋白,664个为非经典分泌蛋白,1824个为未知途径分泌蛋白。对分泌蛋白的功能预测分析表明,有1921个分泌蛋白获得了功能注释,主要涉及信号通路、侵染结构形成、次生代谢、活性氧等胁迫应激反应等;另有845个分泌蛋白功能未知。此外,经典分泌蛋白中预测有32个CAZymes和23个CWDEs。GO功能注释分析表明,有2456个分泌蛋白注释到51个GO功能子类别中。KEGG通路注释分析表明,有1519个分泌蛋白注释到247个KEGG通路中。3、采用Label-free质谱技术,对稻瘟菌附着胞发育期和成熟期的分泌蛋白质组进行了分析。结果表明,(1)有1702个分泌蛋白在附着胞发育期得到了鉴定,有1604个分泌蛋白在附着胞成熟期得到了鉴定。(3)对附着胞2个阶段的的分泌蛋白进行比较分析,共有340个分泌蛋白差异表达;其中,特异性表达的分泌蛋白质有162个(附着胞发育期有93个,附着胞成熟期有69个),显著性差异性表达的有178个。4、应用生物信息学技术,对稻瘟菌附着胞发育不同阶段的差异表达分泌蛋白进行功能预测分析。结果表明,(1)在附着胞发育期,特异性表达的分泌蛋白主要涉及信号转导、脂类代谢、水解活性、能量代谢和蛋白质合成等;附着胞成熟期特异性表达的分泌蛋白主要涉及细胞壁降解、活性氧等胁迫应激反应、能量代谢和蛋白合成等。(2)GO富集分析结果表明,附着胞发育不同阶段的差异表达分泌蛋白参与的生物过程主要有核糖体合成、不依赖于蛋白酶体泛素化的蛋白分解代谢、核糖核蛋白复合体合成等,参与的分子功能有结构分子活性、核糖体结构组分、苏氨酸肽链内切酶活性等,参与细胞组分的有蛋白酶体核心复合体、蛋白酶体复合体、肽链内切酶复合体等。(3)KEGG富集分析结果表明,差异表达分泌蛋白主要参与抗生素合成、蛋白酶体、核糖体、淀粉与蔗糖代谢、TCA循环和HIF1信号通路等。
其他文献
目的:观察甲花片对冠状动脉造影或介入治疗后造影剂肾病患者相关肾脏损伤指标的影响,评价其防治造影剂肾病的临床疗效,为造影剂肾病的诊治提供新的中医临床证据。方法:选取冠
目的:荟萃分析可以实现对多个不同独立的临床研究进行系统的、定量给的综合分析,以便得出更客观地结果,为临床医生在脑积水的治疗中提供指导。方法:通过全面检索英文及中文数据库,如英文数据库Pub Med、Cochrane Library、Embase等,中文数据库万方医学网、中国知网、中国生物医学文献数据库等,同时收集相关会议论文及未发表的论文。检索建库至2020年03月出版的脑室矢状窦分流的相关中英文
弓形虫(Toxoplasma gondii)是在温血动物和人类中普遍存在的一种机会性致病寄生虫,除感染终末宿主猫及猫科动物以外,还可以感染犬、马、鸟类等中间宿主,可导致感染动物母畜流产、死胎、畸形胎等。此外,人类也可感染弓形虫,免疫力降低的人群可导致严重的疾病。犬新孢子虫(Neospora caninum)是一种胞内原生寄生虫,能够感染许多家畜和野生动物,目前确认的终末宿主只有犬及犬科动物,感染犬
RB潜山油藏为厚层状弱边水碳酸盐岩油藏,油藏天然能量较弱、地质条件复杂,经过多年开发,已经进入高含水开发后期。由于该油藏具有地层倾角大、断层发育、储层呈层状且各油组
染料废水的处理一直是令人困扰的问题。这类废水有机物含量高,生物难降解组分多,可生化性差,而且色度高。目前,对于染料废水的处理主要有物理吸附法、生物法、化学氧化法、电
旱地条件下豆科与禾本科作物间作有利于提高氮素利用率及群体产量,但水田环境下水稻(Oryza sativa)与豆科水生作物间作模式的研究报道甚少。本论文在水稻间作模式中引入一种水
1990年联合国开发计划署(UNDP)基于多维视角提出人类发展指数(HDI),从健康、教育和收入维度综合评判地区发展水平和社会进步,受到国际社会的广泛认可,并为各国政府制定相应的发展战略做出重要指导。中国的基本公共服务体系与HDI在思想和内容上具有高度的一致性,研究中国的区域协调发展在一定意义上等同于探究中国区域人类发展问题。但是由于构建过程缺乏生态环境维度的考量,HDI在广泛运用的同时也招致一些
随着我国工业化进程的不断推进,我国农产品已逐步从高产走向优质。近年来,芒果的海外销售有所增加,芒果产品在海外市场的前景非常看好。我国芒果采摘后,一般采用人工分级,即
目的:优选巴戟天的炮制工艺参数,确定盐巴戟天的最佳炮制工艺;比较分析巴戟天盐制前后的糖类成分变化;比较生巴戟天与盐巴戟天的健脑作用,探讨盐制对巴戟天化学成分和药效变化的影响,为中药炮制理论提供科学依据。方法:采用均匀设计法,对影响巴戟天盐制过程中的三个因素:盐水浓度,浸润时间,蒸制时间进行考察,每个因素设计六个水平。采用高效液相色谱法,以盐制后巴戟天的耐斯糖作含量的高低作为评价炮制工艺优劣的指标,
相对于一般建筑而言,人们直觉上会认为高层建筑地震安全性更高,并且历史上高层建筑震害要小很多,工程师对高层建筑抗震性能认知有限。由于重心高,在水平地震作用下,高层建筑会受到很大的倾覆力矩,进而转化为底层边缘构件的附加轴力。有限的震害实例的确暴露了这样的问题。如何克服附加轴力的影响是高层建筑抗震设计面临的主要挑战。本文针对这一问题,先梳理总结了相关的震害,然后通过试验和数值模拟方法探讨了一种克服附加轴