农林牧渔行业是一个在国民经济中占有特殊地位的行业，它关系到整个国家的国计民生问题。农林牧渔类上市公司在股票市场中也同样占有很特殊的地位，正确地给农林牧渔行业上市公司股票进行合理的市盈率估值，对农林牧渔行业的发展具有很重要的意义。本文对影响农林牧渔行业上市公司市盈率的因素进行了实证分析。首先从股票定价模型中推导出影响市盈率的部分因素，然后再根据国内外的研究文献和理论，对影响市盈率的因素进行归类，最终依据数据的可获得性及相关性选取了能够量化的宏观和微观指标。然后采用2000-2010年纵向时间序列数据，分别选取GDP、利率、汇率、通胀率、国家财政及地方政府财政惠农支出等宏观指标作为自变量，行业市盈率作为因变量，根据相应假设，采用实证分析研究这些因素对行业市盈率的影响，并展开讨论。接着采用农林牧渔行业44家上市公司的2006-2010年报的面板财务数据，选取每股收益（EPS）、净利润、每股净资产、流动比率、净资产收益率、支付比率等13个微观指标作为自变量，公司市盈率作为因变量，同样采用实证分析研究对公司市盈率的影响，并结合行业市盈率的影响因素，综合得出一系列的实证结论。