由于目前世界各国主要采用以从价标准为课税标准计算关税，所以确定进出口货物完税价格显得十分重要，同时也影响进口环节的增值税、消费税的计算，海关确定进出口货物完税价格的作业过程称为海关估价。税务部门需要依据正常交易定价原则来调整关联交易的收入与费用，体现的是独立竞争精神进行分配，关联关系不能影响利润在交易双方之间的合理分配，即形成了转让定价的纳税调整制度。探究两者之间的关系即是本文的主旨所在。本文引言部分阐明本文的研究焦点和研究思路。正文部分分为六部分进行讨论，文章结尾得出本文的结论。第一部分主要研究转让定价与海关估价的理论基础。认为二者关系既有共性，也有互补，更有矛盾关系。第二部分以比较研究的方式研究海关估价制度与转让定价调整的各个方面的异同，分别从原则、关联关系认定标准、适用调整方法，以及其他方面进行的比较。得出两套规则之间存在共性，两套规则之间可以协调的结论。第三部分从分析《WTO海关估价协定》与《OECD转让定价指南》所适用的方法出发，寻找彼此存在的问题，彼此是否都可以做出让步。主要从两个角度研究，一是海关估价方法的可比性研究；二是转让定价调整的利润法是否能得出公平价格。第四部分主要介绍国际组织关于海关估价制度与转让定价调整已取得的成果以及国外的具体实践。选取了美国、韩国、加拿大三个国家的具体实践进行介绍，最终总结借鉴经验。第五部分介绍了目前海关借用转让定价方法两个案例，总结目前海关借鉴掌握的经验。第六部分通过对本文的上述研究，总结我国海关估价与转让定价之间存在的三方面的协调障碍，最后相应地提出可行性建议。