免疫共刺激分子OX40在弥漫大B细胞淋巴瘤中基因表达差异和肿瘤微环境中表达特征及临床预后的研究

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:depewguy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)是非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin’s lymphoma,NHL)中最常见的亚型,虽然有很多研究致力于探讨DLBCL的分子机制及驱动基因,但人们对此仍然知之甚少。本研究旨在鉴定DLBCL发生发展过程中的关键候选基因,进一步筛选DLBCL的免疫共刺激分子,并阐明筛选出的OX40在DLBCL肿瘤微环境中的表达特征及与患者的预后关系,以期筛选适合OX40靶点激动剂的DLBCL亚群病人,为DLBCL的精准免疫治疗提供理论基础。方法:1.从GEO数据库获取DLBCL组织和正常淋巴组织的基因表达谱芯片数据。使用GEO2R筛选两者之间上调的差异表达基因。使用STRING在线数据库构建差异表达基因的蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络。使用Cytoscape的MCODE插件识别PPI网络中最重要的模块。模块中的基因被视为影响DLBCL发生发展的关键候选基因,对其进行GO和KEGG功能富集分析。获取Oncomine数据库中OX40在m RNA表达芯片中的表达数据,各自分析OX40的m RNA表达量在DLBCL组织和正常淋巴组织间的表达差异。获取Oncomine数据库中OX40的m RNA的生存数据进行生存分析。2.采用多重免疫荧光染色对229例DLBCL患者石蜡样本及64例周围正常淋巴组织样本中的以下指标进行了荧光染色:OX40,CD4,CD8,Foxp3,Pax-5,DAPI。采用Mantra组织定量成像系统进行多光谱成像及信号拆分,Inform软件进行图像定量统计分析。3.采用非参数秩和检验比较癌和癌旁OX40的表达差异,以及OX40在三种不同T细胞亚型(包括CD4~+T细胞、CD8~+T细胞和Treg细胞)肿瘤微环境的表达差异。4.将表达OX40的每种微环境细胞各自的细胞数转化为每平方厘米的相对细胞数,采用中位数将OX40的总表达量分为高表达组和低表达组,肿瘤微环境中OX40~+CD4~+T淋巴细胞、OX40~+CD8~+T淋巴细胞、OX40~+Treg细胞采用同样的方法确定临界值。5.进行生存分析以评价总的OX40的表达高低以及在不同亚型T细胞上的表达高低对患者预后的影响。采用多因素Cox比例风险回归模型来评估各项预后因素。结果:1.筛选获得DLBCL组织中598个重叠的上调差异基因。分析获得差异表达基因中最重要的四个模块,其中涉及到142个关键候选基因。这些关键候选基因主要富集于PI3K-Akt、局灶性粘连、ECM-受体相互作用和细胞因子-细胞因子受体相互作用等通路。进一步筛选获得关键候选基因中涉及到免疫共刺激信号的分子OX40作为研究目的基因。2.分析显示,OX40在DLBCL组织中的m RNA表达量显著高于正常的淋巴组织(cluster 1,p=0.015;cluster 2,p<0.001)。分析显示,OX40的m RNA表达水平越高,DLBCL患者的预后越好(p=0.018)。3.我们分析了64对成对的DLBCL组织和周围正常淋巴组织中OX40的表达情况,发现肿瘤组织中OX40+的细胞数量明显高于周围正常淋巴组织(p=0.029)。OX40的总表达量高低与Ann Arbor分期(p=0.039)和IPI评分(p=0.047)显著相关,患者分期越晚、IPI评分越高,OX40的表达量越低。在121例接受了R-CHOP-like治疗并进行了疗效评价的患者中,CR与PR患者OX40的表达量没有显著差异,但是与SD/PD患者相比,二者OX40的表达量均明显升高(p=0.002;p=0.002)。在整个队列中,总OX40高表达组患者和低表达组患者的平均生存时间分别为87.9个月(95%CI:79.3-96.4)和66.8个月(95%CI:57.9-75.6),平均复发时间分别为78.0个月(95%CI:68.6-87.3)和55.7个月(95%CI:48.7-66.7)。与低表达组患者相比,高表达组患者的OS(p=0.008)和PFS(p=0.010)均显著延长。当在接受R-CHOP-like治疗的患者中进行比较时,这种差异仍然很显著(p=0.020;p=0.021)。4.在229例DLBCL组织中,OX40在CD4~+T细胞、CD8~+T细胞和Treg细胞上表达的细胞密度分别为2160/cm~2、279/cm~2和111/cm~2(p<0.001),表达的阳性率分别为16.67%、0.98%和44.75%(p<0.001),可见OX40尽管主要表达在CD4~+T细胞表面,并且以Treg细胞为主,但是表达OX40的CD8~+T细胞密度却显著高于表达OX40的Treg细胞密度。5.在整个队列中,OX40~+CD4~+T细胞表达高低对患者的OS(p=0.114)和PFS(p=0.367)都没有显著差异。当在接受R-CHOP-like治疗的患者中进行比较时,与低表达组患者相比,高表达组患者的OS(p=0.021)明显延长,但对PFS(p=0.093)依然没有显著影响。在整个队列中,OX40~+CD8~+T细胞高表达组患者和低表达组患者的平均生存时间分别为88.8个月(95%CI:80.4-97.2)和66.0个月(95%CI:57.1-74.8),平均复发时间分别为77.0个月(95%CI:67.6-86.4)和58.8个月(95%CI:49.8-67.8)。与低表达组患者相比,高表达组患者的OS(p=0.004)和PFS(p=0.028)均显著延长。当在接受R-CHOP-like治疗的患者中进行比较时,这种差异仍然很显著(p=0.009;p=0.045)。无论在整个队列中,还是在接受R-CHOP-like治疗的患者中,OX40~+Treg细胞表达高低对患者的OS(p=0.283;p=0.530)和PFS(p=0.201;p=0.534)都没有显著差异。6.多因素分析显示,OX40~+CD8~+T细胞表达量是DLBCL患者独立的预后因素。结论:通过GEO数据库筛选并鉴定出影响DLBCL发生发展的关键候选基因142个,这些关键基因涉及多条癌基因信号通路。深入筛选获得涉及到免疫共刺激信号的分子OX40作为本研究目的基因。进一步发现OX40在DLBCL组织中的m RNA表达量显著高于正常的淋巴组织,且表达水平越高,患者预后越好。我们的研究发现,OX40在DLBCL组织中的表达显著高于周围正常淋巴组织;OX40表达与患者Ann Arbor分期和IPI评分等临床病理特征显著相关;肿瘤组织中OX40主要表达于CD4~+T细胞,尤其是Treg细胞;OX40总表达高的患者无论OS还是PFS皆显著延长。肿瘤微环境分析发现,OX40在CD8~+T细胞上表达显著影响患者预后,且表达越高,预后越好;但在Treg细胞上表达尚未观察到显著差异。多因素分析发现,OX40~+CD8~+T细胞表达量是DLBCL患者独立的预后因素。
其他文献
认识群落的构建过程是群落生态学的主要任务。但对于这一问题观点各异,有假说认为在环境筛的强选择作用下,群落内植物会向着性状趋同的方向发展;而由于物种间的竞争作用,性状
纳米药物发展至今已有数十年,但是上市或者进入临床研究的甚少,限制其发展的原因众多,生物相容性好、可控性强、价廉易得的构筑材料缺失是限制其发展的重要瓶颈。本论文依据
学位
近年来,研究表明,长非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)不仅在机体的正常发育、分化等生理过程中发挥重要调控功能,其异常表达与疾病(包括肿瘤)的发生发展有着密切的联
模李超代数的研究主要分三个方面,它们分别是分类,结构和表示.模李超代数的表示是研究模李超代数的一个重要方面.本文围绕模李超代数的表示做了些简单的工作.设F是特征p>2的
学位
目的总结我单中心经治食管小细胞神经内分泌癌(SCNEC)的生物学特征、临床表现、治疗及其预后。方法回顾性分析我单中心手术组201 1年1月-2014年12月期间经手术病理证实为食管
近年来,随着人工智能的发展,因无人驾驶汽车可以改变人类出行方式,逐渐成为汽车行业的研究前沿。当前,全球汽车行业正飞速发展,无人驾驶汽车也必将成为新一轮科技竞争的制高点,因此,该领域的研究对于国内科技发展至关重要。本报告基于《无人驾驶原理与实践》一书中第1章初识无人驾驶系统和第3章无人驾驶系统的定位方法的翻译实践,以李长栓在《理解与表达:汉英翻译案例讲评》中提出的“理解、表达、取舍”翻译框架作为指导
黑胫钩额螽(Ruspoils lineosa)隶属于直翅目、螽斯总科、草螽科,在全国各地分布广泛。目前关于黑胫钩额螽的研究主要集中在外部形态及分类系统方面的研究,而有关黑胫钩额螽线
随着经济和时代的变迁,90后这个新生代群体逐渐进入到企业,并且在企业中日趋承担起重要的岗位职能,甚至在一些IT、金融、互联网等快速变化的行业,部分90后员工已经开始迈向了