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深海热液与其所形成的羽流区是全球洋中脊热泉场的重要组成部分,在深海热量和物质循环中具有重要地位,并对全球海洋循环及大洋化学有着重要影响。深海热液区细菌的多样性丰富,具有独特而活跃的代谢活动。同时采用培养方法和不依赖培养的方法,能够更全面地认识和获得环境中微生物资源。西南印度洋中脊(SWIR)由于发现较晚,对其热液区微生物多样性知之甚少。
本文分析了西南印度洋深海热液羽流细菌的多样性特点,不仅深化对该特殊环境微生物对大洋生态系统影响的认识,还可以获得特殊的微生物资源。将西南印度洋深海热液羽流海水进行1000倍原位浓缩,对浓缩海水样品进行富集培养和微生物分离培养;构建原始海水浓缩样品和富集培养物的16S rRNA基因克隆文库,结合分离培养获得的微生物菌株,分析该样品的细菌群落结构和多样性特点。共获得105个16S rRNA基因序列,其中50个来自原始热液羽流浓缩海水样品,40个来自富集培养物,15个来自分离获得的纯培养。序列分析表明,它们分属于α-Proteobacteria(15个)、β-Proteobacteria(5个)、γ-Proteobacteria(74个)、Bacteroidetes(4个)、Firmicutes(2个)、Planctomycetes(2个)、Verrucomicrobia(2个)以及Actinobacteria(1个),共30个不同的可操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)。27个序列与已知微生物16S rRNA基因相似性低于97%,最低的只有86%。菌株8047由于与已知微生物的16S rRNA基因序列相似性最高为93%,因此对它进行多相分类与系统发育研究。结果表明菌株8047T为根瘤菌目(Rhizobiales),橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)的一个新属,命名为Huangiamanganoxydans,菌株804T为其模式菌株。该菌株好氧生长,生长温度4-45℃,生长pH4-9,可异养生长亦可在无碳源培养基上自养生长,能在无氮培养基上生长,并可氧化二价锰离子形成不可溶的四价锰化合物,显示对其生活的热液羽流环境的适应性。结果表明,西南印度洋热液羽流存在较丰富的微生物多样性,以γ-Proteobacteria为优势类群,其次为α-Proteobacteria;同时还存在较多未培养的新微生物属种,鉴定了其中一株新的细菌为Huangia manganoxydans strain8047T。