磷酰化氨基酸作为“微型化活化酶”，对解释一些生命现象、了解酶的作用机制和探讨生命起源等具有重要意义，同时在生物技术、医药等领域也展示着越来越广阔的应用前景。本论文分别运用了两种合成方法对二十种常见氨基酸进行了磷酰化研究，改进了磷酰化氨基酸的制备及纯化方法。 方法一：运用赵玉芬教授研究小组改进的Atherton-Todd反应首次比较全面地合成了二十种磷酰化氨基酸。在实验过程中通过优化反应条件和纯化条件，提高了产率。合成路线如下： 方法二：运用NaClO法对二十种常见氨基酸的磷酰化进行了普适性研究。以亚磷酸二异丙酯为磷酰化试剂、次氯酸钠为氯代试剂首次对20种常见的α-氨基酸进行了磷酰化。通过添加适量四丁基溴化铵为相转移催化剂，使用过量的亚磷酸二异丙酯以补偿其在强碱环境中的水解，从而提高了反应产率。同时又利用正交实验对磷酰化丙氨酸的NaClO方法的合成条件进行了较为深入的探讨，发现反应温度、反应时间、pH、相转移催化剂的用量对产率有较大的影响；反应物物质的量比，萃取溶剂的选择和酸化时的酸度选择对产率有一定的影响；探索了相对可能比较适合“规模化生产”的合成条件。 合成路线如下： 1．所得二十种磷酰化氨基酸均经氢谱、碳谱、磷谱、红外、旋光和质谱几个方面对其进行了结构鉴定，并分析了谱图规律，进一步完善了熔点、旋光度、红外、核磁和质谱数据。 2．利用培养单晶的方法来辅助对其结构进行较为深入地了解，得到了三个单晶，并对其晶体结构进行了分析。 3．利用电喷雾离子阱质谱对环糊精和N-二异丙氧磷酰化氨基酸的作用进行了探索。结果发现：β-环糊精能够催化N-二异丙氧磷酰化氨基酸的水解反应，并对p一环糊精对N一二异丙氧磷酞化氨基酸的水解反应机制进行了推测。而且对日一环糊精和N一二异丙氧磷酸化氨基酸以及氨基酸形成的复合物进行了CID裂解研究，发现二者具有不同的裂解规律。