多元生物分子诊断技术，由于其灵敏度高，编码量大，高通量、反应快速等优点受到广泛关注。其中基于流动编码载体的悬浮芯片技术，能够高效并快速准确地获取多种生物分子的信息，因此，该技术在生物科学领域得到了广泛的应用。目前，悬浮芯片主要采用基于荧光染料的光学编码，但是由于荧光染料编码存在着编码信号不稳定、易光漂白等缺点，限制了其在分子诊断中的研究应用。而本文研究的基于光子晶体编码的液相芯片可以有效地解决荧光染料编码所存在的问题。具体工作如下：　　 (1)设计并构建了重力驱动流体的微流控系统，探讨该系统在乳液的生成、尺寸控制、单分散性、稳定性等的特性，优化了制备尺寸可控的单分散性液滴的条件。　　 (2)通过引入水溶性聚合物，来改进胶体粒子自组装过程。优化了在含有水性聚合物的条件下胶体粒子的自组装条件。该方法提高了光子晶体微球的稳定性。　　 (3)利用光子晶体微球和量子点开发了一种新的二元联合编码策略，并进行了蛋白质分子的多元检测。该方法实现了在不降低检测灵敏度的同时提高了载体的编码能力。　　 (4)研制蛋白响应性非标记水凝胶光子晶体微球，探讨了其对不同浓度抗原分子的响应性；制备多种抗原响应水凝胶光子晶体微球，并用其进行了多元蛋白非标记分析。