3D5细胞cDNA文库的构建及人类α-甘露糖苷酶基因全长cDNA的克隆与序列分析

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目的:糖蛋白中的聚糖不但与蛋白质的生物学功能密切相关,而且本身也有着重要的生物学意义,例如许多微生物对组织细胞的特异性侵袭,涉及到微生物表面凝集素样物质与靶细胞表面糖蛋白受体的特异识别与结合.阻断这种结合可能成为防止感染发生的重要手段.因此对糖蛋白中聚糖的研究已成为继蛋白质和核酸之后又一生命科学的重要研究领域.α-甘露糖苷酶作为一种重要的糖加工酶,参与N-聚糖的加工成熟.学者们已先后从酵母和多种哺乳动物细胞中克隆出了十多个不同的α-甘露糖苷酶的基因.其中包括数个人α-甘露糖苷酶的基因.该研究旨在前述工作基础之上,构建更高质量的3D5细胞的λgt 11cDNA文库,继续完成该α-甘露糖苷酶基因全长序列的克隆. 6A8cDNA编码的蛋白质的氨基酸序列与大鼠的ERα-甘露糖苷酶高度同源,相同性和相似性分别高达78﹪和82﹪,与酵母α-甘露糖苷酶的相同性和相似性亦达到33﹪和47﹪.另外,其260-432位氨基酸序列与小鼠、大鼠、猪和人类的多种α-甘露苷酶的相应氨基酸序列相比,相同性均有20﹪以上.这充分提示,6A8cDNA编码的蛋白质极可能为一种α-甘露糖苷酶.自6A8cDNA编码蛋白质推断的氨基酸序列分析表明,其氨基酸序列正如大鼠内质网α-甘露糖苷酶和酵母空泡α-甘露糖苷酶的序列一样,其NH<,2>-端不具有典型的信号序列,但符合真核细胞信号序列的最低要求,在7个疏水性氨基酸残基中,Ser,ThrGly或Pro残基未超过一个,并且氨基端至少有一个带有正电荷的氨基酸.其氨基酸序列的亲疏水性分析结果显示,自95-138AA、428-451AA、525-540AA、961-971AA和997-1009AA存在较强的疏水区.对蛋白质二级结构穿膜区预测发现6A8cDNA编码的α-甘露糖苷酶蛋白中有六个有意义的跨膜螺旋区存在,分别为35-57AA、142-163AA、607-629AA、921-942AA、941-959AA和1030-1051AA.但其是否真的存在跨膜区尚待进一步证实.
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