论文部分内容阅读
目的:选择在东亚人群中经全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)发现的与结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)遗传易感性相关的单核苷酸多态(Single Nucleotide Polymorphism,SNPs)位点,在CRC患者外周血样本中重点分析它们与TNM分期之间的关系,探索影响CRC预后的潜在分子标志物。方法:检索GWAS数据库,寻找已发表的有关东亚人群的GWAS,并参照我们的前期研究,选定我们的目的SNPs。本研究以2014年2月至2015年12月间于武汉市相关合作医院接受结直肠癌根治手术的316例患者为研究对象,采集其外周血样本,提取DNA,并系统收集临床、病理资料和进行相关信息的随访。通过Taq Man基因分型技术对选定的SNPs进行检测。应用卡方检验、t检验、logistic回归模型等统计学方法对相关数据进一步分析。结果:我们选定19个位点和316例CRC患者纳入本研究。1:基本信息分析:316例CRC患者的平均年龄是59.73±12.85岁,男性201例(63.6%),女性115例(36.4%)。病例组(T3+T4或N1+N2或M1)和对照组(T1+T2或N0或M1)在性别、年龄、吸烟史、饮酒史分布无显著差异(P>0.05)。2:各位点与CRC的T分期(浸润深度)之间关系:19个位点的基因分型在对照组(T1+T2)中均符合Hardy-Weinberg遗传平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE)法则(P<0.05),经病例对照研究发现有四个位点(rs6687758、rs10505477、rs6983267、rs7014346)的SNPs与CRC的T分期相关。进一步各种模型分析发现:在加性模型中,这种相关性仍然有统计学意义(P<0.05);而显性模型中,只有rs6687758位点的SNP有意义;在隐性模型中,rs10505477、rs6983267、rs7014346位点的SNPs与T分期有相关性。3:各位点与CRC的N分期(淋巴结转移)之间关系:19个位点的基因分型在对照组(N0)中均符合HWE法则,经位点的病例对照初步分析,并没有发现其中有与CRC的N分期相关的SNP。在加性模型、显性模型分析中,各发现一个位点(分别是rs647161和rs6687758)的SNP与CRC的N分期相关;而在隐性模型中,没有发现有意义的位点。4:各位点与CRC的M分期(远处转移)之间关系:有17个位点的基因分型在对照组(M0)中符合HWE法则(两个位点rs12603526、rs2241714不符合HWE法则,P<0.05)。在位点的病例对照分析中没有发现与CRC的M分期相关的SNP。经加性模型、显性模型及隐性模型进一步分析,仍然没有发现相关的位点。结论:选定的19个GWAS发现的位点中,rs6687758、rs10505477、rs6983267和rs7014346位点的SNPs与CRC的浸润深度相关;rs647161和rs6687758位点与CRC的淋巴结转移数目相关;没有发现与CRC的远处转移相关位点。rs6687758、rs10505477、rs6983267、rs7014346以及rs647161位点的单核苷酸多态性可能与结直肠癌的预后相关,有待进一步的研究支持。