生态环境犯罪刑事责任追究是刑事责任追究的一种特殊表现形式,是司法机关根据刑事法律依法追查和落实生态环境犯罪人所实施的破坏生态环境犯罪的法律责任而实施的司法活动。生态环境犯罪刑事责任追究应当坚持刑罚谦抑性原则、责任前置原则、举证责任倒置原则、刑罚及非刑罚方法并用原则以及经济性原则。我国环境刑事立法存在如下问题:环境刑法介入环境问题的度太窄太浅显;环境刑法的前瞻性不够;环境刑事立法缺乏系统性;惩治环境犯罪、适用环境刑法的原则没有与国际社会接轨;环境刑法对环境的惩治太轻;有些地方环境刑事立法的科学性不够。司法上,恢复性司法没有完全得到贯彻,专门环境刑事司法规则缺失,缺乏相对健全和完善的环境司法制度缺乏,生态环境刑事诉讼制度存在瑕疵,刑法没有得到有效执行,环境刑法执行困难,环保行政执法与刑事司法衔接机制运行不畅,检察机关的法律监督不力。应当完善立法,通过倡导恢复性司法理念、推进环境刑事司法专门化、改进我国生态环境刑事诉讼制度、应提高公安机关证据质量、加强环保部门与司法机关的密切联系、加强检察机关法律监督等方式完善司法。