HPV16 E7癌蛋白对宫颈癌Caski细胞circRNA表达谱的影响

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宫颈癌是世界上最常见的女性恶性肿瘤之一,有着较高的发病率及死亡率,在全球范围内分别列第三和第四位,每年大约新增500 000例宫颈癌患者其中260 000人死于该病,严重影响女性的健康。研究表明,宫颈癌是迄今为止与HPV最密切相关的的一种肿瘤。高危型人乳头瘤病毒(High-Risk Human Papillomavirus,HR-HPV)被认为是诱发宫颈癌的主要原因,其中HR-HPV16和18型最为常见,占全球宫颈癌和宫颈癌癌前病变70%以上。E7是HR-HPV编码的主要癌蛋白,可以通过其保守区域LXCXE基序与pRb结合,抑制pRb的作用,最终导致pRb-E2F复合物分解,释放出E2F,并激活细胞周期相关基因,导致DNA合成及细胞由G1期向S期转换,从而促进细胞的增殖。E7的表达与HPV的持续感染密不可分。E7在宫颈癌的发生、发展以及进展中起重要作用,明确其调控的关键环节和关键分子是探寻宫颈癌发病机理以及治疗靶点的重要前提。近年来,环状RNA(circular RNA,circRNA)作为一种新的内源性非编码RNA,在人类疾病的发生发展中发挥重要作用,继微小RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)后,有望成为新的生物标记和治疗靶点受到广泛关注。circRNAs是由外显子或内含子剪接而形成的环状转录物,缺乏5’和3’端。circRNA的保守性、丰度和组织特异性,使其在某些疾病中起到潜在特殊标记分子的作用。研究证明,circRNA可作为竞争性内源RNA或miRNA海绵发挥作用,也可以与蛋白质相互作用,调节基因的表达及蛋白质翻译。在基因表达和转录组学中circRNA具有调节mRNA稳定性的功能。越来越多的证据表明,circRNA在许多种疾病中起到了重要作用。为了探讨与HPV16 E7相关差异表达的circRNA在宫颈癌中的作用,本研究采用RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术在Caski细胞中沉默E7,获得circRNA表达谱。通过箱型图、散点图、火山图及热图分析,筛选出526个差异表达的circRNA(fold change≥2或≥0.5,P<0.05),其中上调的有352个,下调的有174个。从沉默E7和过表达E7两方面验证8个候选差异表达的circRNAs,结果显示,qRT-PCR结果与circRNA芯片结果较为相符。运用Target Scan及miRBase等在线软件预测8个候选circRNAs相互作用的miRNA,分别得到5个最相关miRNAs。从生物学过程、细胞组分、分子功能方面对候选circRNAs进行GO分析,发现circRNA主要参与mRNA剪切、复制后修复、调节蛋白质分解代谢等过程;可作为mRNA切割和多聚腺苷酸化特异性因子复合物、真核翻译起始因子4F复合物、质膜等细胞成分;具有与RNA结合、核糖体小亚基结合和解旋酶活性、中性氨基酸跨膜转运体活性等功能。KEGG通路分析显示circRNA主要参与mTOR信号通路、脂肪酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢等通路。综上所述,本文首次通过circRNA芯片分析并确定了受HPV16 E7调控的候选circRNA分子,结果表明E7癌基因可能通过影响circRNA的表达促进宫颈癌细胞的恶性表型。此外,本研究不仅对于对揭示circRNA在宫颈癌中的作用具有重要的价值,同时有望为宫颈癌诊断和治疗提供新的潜在生物标志物。
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