黄颡鱼(Pseudobagrus fulvidraco)是为我国特种水产养殖中的重要品类。本文通过大规模养殖实验,研究了人工浮床水培水雍菜对池塘养殖废水中氮、磷等富营养物质的去除能力,并采用Illumina平台高通量测序方法对水雍菜浮床养殖模式下黄颡鱼肠道及环境微生物的多样性进行了研究,为一步推广水雍菜浮床养殖模式以及黄颡鱼的科学健康养殖奠定理论基础。本次研究的主要结果如下:2014年6月-10月,在面积为8000 m2的黄颡鱼养殖池塘中铺设覆盖度为水面面积7%的水蕹菜浮床,另设无浮床的池塘作为对照,通过测量水体中氮磷等营养元素的分析表明,在养殖过程中水蕹菜浮床对养殖池塘水质的净化作用比较显著。本研究采集了铺设水雍菜浮床的实验组和对照组中黄颡鱼肠道、池塘水体、池塘底泥、水雍菜根系以及颗粒饲料共13份样品,通过高通量测序方法对16S r RNA基因的V3-V4可变区进行测序分析。经过检测发现所有的样品中均有较高的细菌多样性,每个样品获得了9489到30,060条不等的有效序列,13个样本共获得了204,575条序列,这些序列在97%的序列相似水平上共获得15220个OTU,其中肠道样品中检测到123-164个OTU,水体样本中检测到879-1660个OTU,底泥样品中检测到1568-2098个OTU,水雍菜根系样本中检测到1121个OTU,颗粒饲料中检测到214个OTU。在不同的养殖时期黄颡鱼肠道的微生物多样性差异较大,养殖初始阶段黄颡鱼肠道中优势细菌门为Proteobacteria,相对丰度为88.56%,显著高于养殖末期对照组和实验组(14.56%和36.72%);Fusobacteria在养殖末期显著升高,相当丰度由养殖初期的4.07%上升为养殖末期对照组和实验组的32.52%和17.48%。同时结果显示在不同养殖环境下黄颡鱼肠道的微生物多样性存在一定的差异,水雍菜浮床养殖模式下的多样性低于对照组。颗粒饲料中99%以上的序列由三个菌门组成:Cyanobacteria、Proteobacteria、Firmicutes;水体和底泥样本中的优势细菌门均为为Proteobacteria,其在水体样本中相对丰度为54.40%-59.59%,底泥样品中相对丰度为30.07%-47.31%。水雍菜根系样本与水体样本差异不显著,水雍菜根系周围能够有效的吸附氨氧化细菌。聚类分析、主成分分析和主坐标分析结果表明,水雍菜浮床的搭建能够改变养殖水体和底泥中的微生物的群落结构,但是这两者中微生物群落结构的改变与黄颡鱼肠道中微生物群落的变化并无显著关系;黄颡鱼肠道中细菌的构成与饲料中菌群的结构存在一定的相关性。通过以上研究,水雍菜浮床在生产养殖过程中能够有效的净化养殖水体水质,同时,通过高通量测序技术证明了不同养殖模式下黄颡鱼肠道菌群的差异,其肠道菌群与所投喂颗粒饲料中细菌的分布有一定的相关性,养殖水体和底泥中的菌群几乎对肠道菌群没有影响。这一研究为今后黄颡鱼肠道菌群研究提供了理论基础支持,同时使我们对于水雍菜浮床对黄颡鱼肠道及养殖环境中菌群结构的影响有了更全面的认识。