前列腺组织中差异表达基因的筛选及临床验证

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:SANTACRUZ1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]1.利用生物信息学方法分析公共数据库中前列腺癌及正常组织基因表达谱芯片,筛选与前列腺癌相关的差异表达基因,为后续的临床研究奠定基础。2.对目的基因TRIP13进行临床研究。通过PCR、免疫组化等方法检测前列腺癌、前列腺癌旁和前列腺增生组织中TRIP13的表达水平,研究TRIP13在前列腺癌发生发展作用机制,并评价TRIP13在前列腺疾病患者中的潜在应用价值。[方法]1.采用GEO数据库中获取的共享前列腺癌基因表达谱芯片数据,利用R软件中的limma、ggplot2、Hmisc等工具进行数据挖掘,分析差异表达基因,通过生物信息学工具DAVID、STRING对筛选出的基因进行G0、KEGG Pathway分析。2.收集2017年6月-2018年12月在昆明医科大学第二附属医院就诊患者的行前列腺癌根治的癌、癌旁及前列腺增生的组织标本,以及临床相关资料,共110例,对组织标本按照PCR和免疫组化检测要求分别进行处理。采用RT-PCR方法、免疫组化法检测组织中TRIP13基因和蛋白的表达水平,并与患者临床病理资料进行统计分析,分析TRIP13表达水平与患者年龄、TNM分期、淋巴结转移、gleason评分的相关性,探讨TRIP13在前列腺癌发生发展中的作用。[结果]通过表达谱基因芯片共筛查出298个差异表达的基因,其中116个上调,182个下调。采用(logFC>2,P<0.05)过滤共有52个基因满足要求。对这些基因进行一系列生物信息学分析筛选出KIF20A、DLGAP5、HMMR、TOP2A、MELK、TRIP13、TACC3、CENPM共8个基因,结合文献分析认为TRIP13可能是影响前列腺癌发生发展的致病因素[1,2]。RT-PCR结果显示:TRIP13基因在前列腺癌及癌旁组织中的表达明显高于前列腺增生组织(P<0 05),癌和癌旁之间表达差异无统计学意义(P>0.05)。TRIP13基因表达水平与患者年龄、PSA水平、GLEASON评分和TNM分期之间无相关性(p>0.05)。免疫组化结果显示:前列腺癌中TRIP13蛋白水平明显高于前列腺增生组织,与PCR结果的相一致。[结论]1.通过表达谱基因芯片筛选出8个基因在前列腺癌中存在显著差异性表达。其中TRIP13可能是影响前列腺癌发生发展的一个关键基因。公共数据库的挖掘能有效获得疾病致病因素的有用信息。2.前列腺癌组织中TRIP13基因表达与增生和癌旁组织相比呈显著高表达,但TRIP13蛋白表达水平和年龄、前列腺特异性抗原、TNM分期之间无相关性,癌组织TRIP13蛋白水平显著高于增生,进一步证实了TRIP13蛋白在前列腺癌的发生发展中有一定的生物学作用,为TRIP13蛋白引入前列腺癌分子靶向治疗和作为潜在的诊断指标提供了实验数据支持。
其他文献
髓过氧化物酶是一种主要由中性粒细胞分泌的白细胞酶,在心血管疾病的发生发展中,包括发病初期、发展及动脉粥样硬化急性复合病变期,MPO及其介导的炎症途径促进了动脉粥样硬化
太阳光逼虫法。可在日照充足时,选择水泥板地面,将有巢虫的脾上的蜜蜂抖掉,拿着巢脾离地面3cm左右,让阳光照射4~5min,巢虫很快爬出。注意:不能晒太久,防止蜂脾熔化。我不提倡虫脾再用
期刊
西南地区河床覆盖层深厚,如何经济快速地获取地基工程场地的横波速度是水利水电工程勘察的重要问题之一。面波勘探技术以其低成本、快捷及受场地条件限制小等优点被广泛应用
结合制作信息素质教育网页的实践,论述信息素质教育网页的总体设计思路,制作时的注意项及思考。
悬臂式掘进机具有掘进成洞速度快、作业效率高、操作灵活、进尺成本低、劳动强度低等优点,被广泛应用于隧道、煤矿等领域。为了提高采掘效率,掘进机朝着大型化和智能化的方向
在刚刚过去的第49届世界标准日上,国际电工委员会(IEC)、国际标准化组织(ISO)、国际电信联盟(ITU)将2018年世界标准日的主题确定为“国际标准和第四次工业革命”,致辞中提到“两个世
报纸
目的 探讨外伤性膀胱破裂的诊治方法。方法 回顾性分析10例外伤性膀胱破裂的诊断及治疗情况。采用膀胱注水试验及膀胱造影明确诊断;急诊行膀胱Ⅰ期修补.高位膀胱造瘘.耻骨后引流
葫芦素是药西瓜中重要的药用活性成分,具有抗炎、保肝、抗癌、提高机体免疫力等多种生物活性功能。植物体内葫芦素配糖体与葫芦素的含量相当,已有研究表明葫芦素E配糖体(CuE-
在当下,电梯作为一种垂直运输工具,被广泛应用于商场、学校、居民楼以及办公楼等公众场合,而电梯制动器作为保护电梯安全运行的主要部件,随着使用时间增加,各部件不断磨损老化对电梯制动器可靠性具有决定性影响,因此开展电梯制动器设备退化机制研究,对电梯的安全运行与人身财产安全具有重要的意义。欲深入研究电梯制动器退化过程建模与维修周期预测问题,探索退化过程中一般规律,论文依托于《中国沈阳电梯大数据检测预警平台