紫菜是红藻门(Rhodophyta)原红藻纲(Protoflorideophyceae)红毛菜目(Bangiales)红毛菜科(Bangiaceae)紫菜属(Porphyra)大型海藻的总称，目前全世界报道的紫菜约有134种。条斑紫菜(P.yezoensis Ueda)是太平洋西部特有的物种，主要分布于中国、日本和朝鲜半岛，为目前最具经济价值的栽培海藻之一。条斑紫菜是潮间带藻类的代表性模式物种，其基因组较小(碱基数目为10<8>数量级)，染色体数目少(配子体仅3条染色体)，能够在实验室条件下完成生活史，遗传转化系统研究亦取得了初步的进展，这些特性使条斑紫菜成为遗传学、分子生物学和基因组学研究的好材料，具有很高的科学研究价值。 近年来，条斑紫菜相关研究进展迅速，国内外学者先后发布了2万余条条斑紫菜表达序列标签(ESTs)，为克隆条斑紫菜功能基因、并深入了解其遗传特性提供了条件。我们利用实验室已建立的条斑紫菜表达基因文库EST进行序列分析，获得了与多聚泛素基因相关的EST序列，运用生物信息学手段对得到的83条条斑紫菜多聚泛素基因相关的EST序列进一步分析，设计引物通过PCR技术克隆了条斑紫菜的两个多聚泛素基因。 泛素(ubiquitin)是由76个氨基酸组成的高度保守的小分子蛋白，参与到细胞生理活动的方方面面。泛素由两类基因编码，单体泛素融合基因和多聚泛素基因。多聚泛素基因广泛存在于酵母、植物和动物中，由数目不等的首尾相接的228bp的单体重复而成，一般不含内含子。本文克隆到的条斑紫菜的两个多聚泛素基因(polyubiquitin)，具有典型的多聚泛素基因结构，cDNA序列全长分别为1596bp(PUBI-1)和1368bp(PUBI-2)，分别为7个单体和6个单体构成的多聚泛素，不同于红藻中已有研究的Aglaothamnion neglectum、Gracilaria verrucosa和 G. lemaneiformis均有一个多聚泛素基因(且多聚泛素基因都是含有6个泛素单体)；条斑紫菜多聚泛素基因编码区密码子的平均GC含量为60％，第三位密码子位置的GC含量高达90.1％；而且在进化中经历了协同进化，与真红藻亚纲的4个多聚泛素基因不同。多聚泛素基因在酵母和藻类中的抗逆作用已经有详细的研究。条斑紫菜作为一种重要的海洋经济作物，探索其抗逆机制有非常重要的意义。本研究克隆了条斑紫菜的多聚泛素基因，这为探索多聚泛素基因在紫菜抗逆中的作用奠定了基础，也为检验多聚泛素基因的进化机制提供了第一手资料。