淋巴瘤组织中EBV即刻早期基因BRLF1多态性检测与分析

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目的EB病读(Epstein-Barr virus, EBV)是一种嗜人类B淋巴细胞的γ疱疹病毒,与鼻咽癌、胃癌以及淋巴瘤(Iymphoma, L)等多种恶性肿瘤的发生和发展有关。EBV感染宿主细胞包括潜伏期和裂解期两个阶段,其即刻早期基因BRLF1编码产物Rta蛋白是EBV从潜伏期进入裂解期的关键性调节因子。目前Rta蛋白已成为治疗EBV相关肿瘤的靶蛋白,但有关EBV阳性淋巴瘤组织中BRLF1基因多态性的研究甚少,本研究旨在明确EBV阳性淋巴瘤组织中BRLF1基因的变异规律,探讨其变异意义。方法采用原位杂交技术检测淋巴瘤组织中EBV编码小RNA1(EBV-encoded small RNA1, EBER1)筛选EBV阳性淋巴瘤标本;石蜡包埋组织DNA提取试剂盒法提取EBV阳性淋巴瘤组织DNA; PCR技术结合DNA测序检测EBV阳性淋巴瘤组织中BRLF1基因多态性;采用DNAstar软件对其测序结果进行序列比对分析,并与EBV标准株B95-8序列以及本实验室以往EBVaGC, NPC和TW(咽漱液)中BRLF1基因的多态性检测结果进行比较。结果原位杂交筛选出60例EBV阳性淋巴瘤标本,有27例阳性淋巴瘤标本BRLF1基因扩增成功,与B95-8标准序列比对分析,共发现39处核苷酸位点发生变化,其中20处为无义突变,19处为有义突变。亚型分布:8例属于BR1-A型,18例属于BR1-C型,1例为BR1-E型;其中以BRl-A和BR1-C亚型最为常见,分别为29.6%(8/27)、66.7%(18/27)。综合以往研究结果,在EBVaGC, NPC,淋巴瘤以及健康人等4种人群中BRLF1亚型的分布不同,其中健康人群以BR1-A亚型多见,BR1-C亚型更多出现在NPC和淋巴瘤中。在Rta蛋白功能区中,二聚体区域呈高度保守,在DNA结合区域和反式激活区域均检测出序列突变,16种CTL抗原表位中,只有NAA、QKE和ERP表位发生改变,且NAA和QKE在健康人群中突变率较高。结论青岛地区EBV阳性淋巴瘤组织中BRLF1基因变异类型主要为BR1-A、亚型和BR1-C亚型:BR1-C亚型可能与淋巴瘤相关;发生在Rta蛋白DNA结合区域和反式激活区域的突变可能对其功能产生影响;多数CTL表位序列保守提示BRLF1可以用作EBV相关淋巴瘤免疫治疗的靶基因。
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