浙江省主要鸭种资源遗传多样性研究

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本研究以浙江省9个鸭群体(缙云Ⅰ系,缙云Ⅱ系、缙云青壳系、绍兴鸭带圈白翼梢系、绍兴鸭红毛绿翼梢系、绍兴鸭白羽系、绍鸭青壳系、白羽番鸭和灰羽番鸭),总计230份样品为研究对象,利用20对多态性较好的微卫星标记分析了品种的等位基因频率、基因杂合度、多态信息含量、遗传分化系数以及群体间遗传距离进行分析,得到了由Nei氏遗传距离和标准遗传距离为基础的UPGMA聚类图,从分子水平上反映9个鸭群体的遗传差异和亲缘关系。实验结果表明:1.20个微卫星标记在这9个鸭群体中共检测到308个等位基因。平均每个位点检测到的等位基因数目为15.4个,数目最多的位点是AY493301,为49个,最少的位点是APL515886和AY587043,为4个。每个位点的等位基因在不同品种中的分布不平衡。2.20个微卫星位点在9个鸭群体中均具有较高的多态性,其平群杂合度在0.5860和0.6918之间,平均多态信息含量在0.5501和0.6372之间。其中绍鸭青壳系的遗传变异程度最大,其平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.6918和0.6372;而缙云青壳系的遗传变异程度相对较小,其平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.5860和0.5319。3.F-统计检验结果显示:9个鸭群体在20个位点上的亚群体间的固定指数(Fis)的平均值为0.1045。Fst的平均值为0.2967,说明这几个品种呈高度分化状态。基因流(Nm)在3.2030(AY498543)和0.1825 (CM0271211)之间变动,平均值为0.5926。4.遗传分化系数(GST)计算表明:9个鸭群体的GST值为0.266935,其中以微卫星AY587043分化最大为0.470119,微卫星AY493289分化次之为0.329975。说明有26.69%的遗传多样性分布于群体间,剩余的73.31%分布于群体内,其分化程度较大,这是由于经过系统的人工选育,地理隔离造成的。5.根据Nei氏标准遗传距离(Ds)和DA遗传距离进行系统发生树的法聚类法聚类和NJ法聚类,并用bootstrap重抽样技术对各系统发生树的可靠性进行了检验,其中以Ds遗传距离UPGMA法聚类的结果较准确,9个鸭群体大致可聚为3类:Ⅰ类缙云Ⅰ系、Ⅱ系先聚在一起,再与缙云青壳系聚在一起,然后与绍鸭带圈白翼梢系,绍鸭红毛绿翼梢系,绍鸭青壳系聚为一类;Ⅱ类绍鸭白羽系独自聚为一类;Ⅲ类白羽番鸭、灰羽番鸭聚为一类
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