云南西部HIV阳性者感染弓形虫的SAG2基因位点研究

来源 :大理学院 | 被引量 : 2次 | 上传用户:absyou
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
刚地弓形虫是一种专性细胞寄生原虫,可以感染包括人类在内的几乎所有脊椎动物,并在世界范围内传播,引起人兽共患寄生虫病。同时弓形虫是一种机会性致病原虫,免疫功能正常的人感染后常呈隐性感染,但在艾滋病、恶性肿瘤、长期应用免疫抑制剂治疗的患者或其它免疫功能严重受损者,弓形虫是引发致死性病变的主要原因之一。弓形虫病是AIDS最常见的机会性感染疾病之一,也是引起中枢神经系统局灶性占位症状最常见的原因。随着国内艾滋病发病率逐年升高,弓形虫感染引起的相关性疾病发生率也在升高,在世界很多地方还发生过流行,给人类带来巨大的健康威胁和经济上的严重损失,因而受到了越来越大的重视。不同地区或同一地区不同宿主的弓形虫基因型不同。常规聚合酶链反应(polymerase chain reaction PCR)技术及其衍生技术广泛应用于克隆基因、基因测序、基因分型等医学基础和临床研究中。通过运用PCR技术对弓形虫基因进行研究,可将弓形虫基因型分为I型、Ⅱ型和Ⅲ型,I型是公认的强毒株,主要引起先天性弓形虫病。其余两型属弱毒株,Ⅱ型多见于人体感染,Ⅲ型多见于动物感染。弓形虫不同虫株基因组之间存在微小差异,这可能是导致不同虫株之间的毒力、感染力等方面差异的原因,不同基因型的弓形虫虫株对药物的敏感性也不同。通过对弓形虫株基因鉴定和分型为弓形虫群体生物学、流行病学、疾病的防治等提供重要的依据。本实验通过采集云南西部HIV阳性者的血液,对弓形虫IgG和IgM阳性的全血样本进行基因提取,运用巢式PCR和RFLP等技术分析,与弓形虫国际标准株进行比较,对云南西部HIV阳性者血液内分离的弓形虫SAG2基因(241bp、221bp)进行遗传标记的分析,探讨云南西部HIV阳性者感染弓形虫的基因型,为发病机制和感染免疫的深入研究及临床治疗提供依据。1.研究目的:了解云南西部HIV阳性者感染弓形虫的基本情况,初步分析并确定云南西部HIV阳性者感染弓形虫的主要基因型,从而为云南西部HIV阳性者弓形虫病的防治及其流行病学研究提供重要理论依据。2.研究方法:2.1样本收集收集云南省龙陵县、大理市、临沧市艾滋病防治机构的HIV阳性者血液样本,均经蛋白印迹(WB)试验阳性确证。2.2弓形虫抗体检测将收集到的HIV阳性者血清样本应用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行弓形虫IgG和IgM抗体检测,筛选出弓形虫IgG和或IgM阳性的样本。2.3弓形虫基因提取及扩增、回收、纯化采用全血基因提取试剂盒对HIV阳性者弓形虫IgG和IgM阳性的血液样本进行基因提取;引用国际上比较成熟的引物及巢氏PCR技术对弓形虫SAG2基因进行扩增,经两轮扩增后电泳,全自动凝胶成像分析系统进行分析。对弓形虫SAG2基因扩增阳性的,用凝胶回收试剂盒进行回收、纯化。2.4酶切用限制性内切酶Sau3AI和HhaI对弓形虫SAG2基因扩增阳性产物进行酶切,酶切后电泳结果与弓形虫标准株进行对比、鉴定,确定基因型。2.5测序将弓形虫SAG2基因扩增阳性的产物进行回收、纯化后,共挑选7份(1份纯化弓形虫速殖子、6份HIV阳性者血液样本)送到上海立菲测序有限公司进行测序,测序结果与Genbank上注册的弓形虫株基因序列进行对比分析。3.结果:3.1血清抗体检测本次检测共392份全血样本,其中弓形虫IgG抗体阳性114份,阳性率为29.1%;弓形虫IgM抗体阳性有13份,阳性率为3.3%。本次检测共挑选出127份弓形虫抗体阳性的HIV阳性者全血样本。3.2基因扩增及酶切本实验对SAG2基因扩增阳性的120份全血样本进行酶切,电泳成像后分别可见一大小约241bp、221bp的条带,分别经两个酶切后见到目的基因条带,与国际弓形虫标准基因型株(RH株)进行对比。由于本实验室缺乏Ⅱ型和Ⅲ型弓形虫标准株,根据参考文献进行对比分析,结果119份与国际标准株(RH株)一致,只有1份与Ⅲ型一致。3.3序列分析云南西部HIV阳性者感染弓形虫株SAG2基因测序6份,6份源于随机选择的酶切标本。虽然各弓形虫株SAG2基因之间的差异率非常小,但6份弓形虫株进行基因测序的部分碱基对仍存在缺失、插入或突变。将弓形虫标准株(RH)、云南省HIV阳性者感染弓形虫株(样本)和Genbank注册的弓形虫株基因序列进行对比分析,它们之间的碱基对差异主要有以下几处:241bp的差异:样本3、4、7在第182对碱基处有G的缺失。221bp的差异:样本4在第31对碱基处G变为C,第48对碱基处G变为A,第163对碱基处有T的缺失;样本5在第84对碱基处G变为T,第163对碱基处G变为A;样本6在第163对碱基处G变为C,C后插入了A;样本2、3、7在第163对碱基处T变为C,第165对碱基处G变为A。可见样本4的碱基变化较多,说明与标准株(RH)基因型不一致,有可能是其它基因型,而样本4酶切结果初步确定为Ⅲ型,恰好与测序结果一致。因此,完全排除了样本4不是I型,要完全确定样本4是否是Ⅲ型有待进一步研究。4.结论4.1云南西部HIV阳性者弓形虫感染率高于全国正常人群的平均水平。4.2初步确定云南西部HIV阳性者感染弓形虫的基因型主要以Ⅰ型为主,Ⅲ型少见,未见基因Ⅱ型和其它基因型。5.本实验研究的创新点5.1本实验通过收集云南西部三地区艾滋病防治机构的HIV阳性者血液样本,进行弓形虫SAG2基因提取、扩增、酶切及序列分析,进一步结合弓形虫株B1基因、GRA6基因的研究结果进行综合分析,初步确定云南西部地区HIV阳性者感染弓形虫的基因型。5.2本实验主要有以下两个方面的创新点:5.2.1直接从云南西部HIV阳性者全血样本中提取弓形虫基因并成功扩增出弓形虫SAG2基因。5.2.2从SAG2基因位点进行分析,初步确定云南西部HIV阳性者感染弓形虫的基因型。
其他文献
城镇化的迅速发展,带来了乡村的退化。为了解决这一问题,中共十九大提出了"乡村振兴"的发展战略。研究在归纳了国内外相关理论与实践基础上,探索了一条符合空港新城自身特点
本报讯 记者王峰 通讯员吕元兆 陈东报道 近年来,为推进“三农”信贷业务发展,扬州农行扩大了“三农”征信建设,加大了面向农村的“三农”征信宣传力度,初步建立了“三农”征信
报纸
脑科学家研究,人的大脑中在下丘脑和边缘系统有"乐趣"中枢和"苦痛"中枢,如果乐趣中枢被激活,人就可以乐此不疲的去做事情,而且在做事情的过程中主动愉快,"乐趣"中枢对学习和记忆影
现阶段钢节点的设计思路主要有两种,加强型或者削弱型设计。本文对这种新型节点(以下称为盖板加强型狗骨式节点)的力学性能进行了研究。研究结果表明,梁翼缘削弱深度、梁翼缘削
白酒属于传统产业,一直以来主要采用人工传统的方式生产,为了适应现代化工业的发展,白酒生产必须向酿酒操作机械化、自动化方向发展。本研究主要致力于酿造车间的机械化构建,
目的探讨慢性乙型重型肝炎和慢性乙型重度肝炎患者外周血中Th17细胞和Treg细胞及其相关因子表达水平间的关系。方法选择2010年1月~2012年6月我院收治的26例慢性乙型重型肝炎患
目的;研究人类不同成熟期卵子冷冻与复苏的实验条件,观察慢冻速融后卵子形态、存活状况。探讨卵子冷冻的方法。方法:收集自愿捐赠获得的辅助生殖周期中的卵母细胞进行慢冻速融,观
目的调查分析社区居民对食管癌防治知识的认知情况。方法选取2016年3月至2018年3月本院所在社区的108名社区居民为本次研究实验对象,对其采用问卷调查法,自制食管癌防治健康
<正>1.背景儿童肥胖是一种严重的健康问题,儿童肥胖能预测成年期肥胖。儿童时期是预防不良健康习惯形成的关键时期。培养健康饮食习惯和能力可能是预防儿童肥胖的有效方法。
会议