木材基因数据库的建设

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木材的主要成分是植物细胞的细胞壁,在当下生产和生活中扮演着不可或缺的角色。除了在房屋建造领域有着重要的作用之外,某些树种的木材还可以制成家具,在生活中有着广泛的应用。另外,木材也是制造纸张的原材料,是生活中不可或缺的重要资源。然而,我国的木材的人均拥有量非常低,每年都需要从国外大量的进口以填补缺口。为了提高木材的产量,细胞壁和木材形成过程的相关基因一直是植物学研究中的热点。木材基因数据库(http://me.lzu.edu.cn/woodfor mation/)收集了大量与木材形成过程相关的基因,并开发了一个综合性的数据库在线供科研工作者访问。为了创建这个数据库,本研究收集了大量的已发表的植物基因组数据,并用BLAST和HMMER对细胞壁和木材形成的相关基因做了预测和整理。至今为止,本数据库共收录丁’47个基因家族/超家族,和57个已发表的植物基因组(包括了28个草本植物,22个木本植物,7个非维管植物),总计40,000余万条基因序列。为了方便访问者对这些基因序列进行检索,本数据库提供了多种的检索方式并且检索的结果可以进行免费的下载,并且本数据库还支持在线的比对和建树分析的功能。木材基因数据库整合了当下已发表的植物基因组,并为科研工作者提供一个基因查询、下载和分析的综合性平台。因此,木材数据库对专注于细胞壁和木材研究的科学研究者有着很大的帮助。
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